RNA–Protein interactions for RNA: YOR328W

PDR10, Transcript of ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR10, Length 4,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR10	YOR328W	MRPL3	P36516	390 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	STD1	Q02794	444 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	ISU2	Q12056	156 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	BAR1	P12630	587 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YND1	P40009	630 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YGR039W	P53225	103 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	INP53	Q12271	1107 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	MAL32	P38158	584 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	MSY1	P48527	492 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	MAL12	P53341	584 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	PDR17	P53844	350 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	ASR1	Q06834	288 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	SEC12	P11655	471 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	MST27	P53176	234 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YPS7	Q06325	596 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	SWM1	Q12379	170 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	THI4	P32318	326 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YFR045W	P43617	309 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	DUG3	P53871	357 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	AIM11	P87275	137 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	FRE7	Q12333	620 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	COX1	P00401	534 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	SGA1	P08019	549 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	RPE1	P46969	238 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YGR012W	P53206	393 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	COQ10	Q08058	207 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	SIR2	P06700	562 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	CTA1	P15202	515 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	PAU24	P38155	120 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	AME1	P38313	324 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	CYB5	P40312	120 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YIL169C	P40442	995 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YNR066C	P53752	436 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	MCP1	Q12106	302 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	RNH203	Q12338	110 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	EAF3	Q12432	401 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	IZH2	Q12442	317 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YPR015C	Q12531	247 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
PDR10	YOR328W	GPX2	P38143	162 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	IKI1	P38874	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	BNA7	Q04066	261 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	DAL4	Q04895	635 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	SPR28	Q04921	423 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	RSC58	Q07979	502 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YKR073C	P36153	106 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	FAT1	P38225	669 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	UBS1	P38290	277 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YEA4	P40004	342 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	PGD1	P40356	397 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YIL152W	P40455	235 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YNR064C	P53750	290 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	FIT1	Q04433	528 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	TVP18	Q04767	167 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	MDH2	P22133	377 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	RIB7	P33312	244 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	YKL107W	P34251	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	ECM15	P35195	104 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	GOS1	P38736	223 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	CHS7	P38843	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	EMC5	P40540	141 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	ATG39	Q06159	398 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	RFM1	Q12192	310 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDR10	YOR328W	QCR7	P00128	127 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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