RNA–Protein interactions for RNA: YLR373C

VID22, Transcript of Glycosylated integral membrane protein localized to plasma membrane, yeast

Gene VID22, Length 2,706 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VID22	YLR373C	YIL152W	P40455	235 aa		4.11	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	RNH201	P53942	307 aa		4.11	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	CCE1	Q03702	353 aa		4.11	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	POM33	Q12164	279 aa		4.11	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	MSW1	P04803	379 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	CTA1	P15202	515 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	YGL010W	P25338	174 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	MXR2	P25566	168 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
VID22	YLR373C	PAU15	P40585	124 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	FLC3	P53121	802 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	IZH3	Q07959	543 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	ERV2	Q12284	196 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	EHD3	P28817	500 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	AGE2	P40529	298 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	IDP2	P41939	412 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	ZIM17	P42844	174 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	VAM3	Q12241	283 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	NAT3	Q06504	195 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	CTR3	Q06686	241 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	MCH4	Q08268	501 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	USV1	Q12132	391 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	FYV7	Q12247	151 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	MCT1	Q12283	360 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	ISA2	Q12425	185 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	MPD2	Q99316	277 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	CKA1	P15790	372 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	PDX1	P16451	410 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	YCR025C	P25352	136 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	OAR1	P35731	278 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	SHG1	P38337	142 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	UIP3	P39547	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	MGA1	P53050	456 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	XYL2	Q07993	356 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	YCT1	Q12235	531 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VID22	YLR373C	COX2	P00410	251 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	CHO1	P08456	276 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	LDH1	P38139	375 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	YHR180W	P38868	163 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	HSP10	P38910	106 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
VID22	YLR373C	YEA4	P40004	342 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	GWT1	P47026	490 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	YJR012C	P47087	207 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	YLR152C	P54072	576 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	SAE3	P89114	91 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	THI74	Q04083	370 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	SHH3	Q04487	196 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	CTS2	Q06350	511 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	FCY22	Q12119	530 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	IZH2	Q12442	317 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	BLM10	P43583	2143 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	DAL3	P32459	195 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	REC114	P32841	428 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	MRPL15	P36523	253 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	YER188W	P40103	239 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	YNR066C	P53752	436 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	GRE1	Q08969	168 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	UBA3	Q99344	299 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	QCR2	P07257	368 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	PAM17	P36147	197 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	FRM2	P37261	193 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	STS1	P38637	319 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	SPC25	P40014	221 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	HUA1	P40325	198 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	ATG27	P46989	271 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	CCC1	P47818	322 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	YGL235W	P53071	178 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	DAD3	P69850	94 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VID22	YLR373C	RSM10	Q03201	203 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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