RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	ERV29	P53337	310 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	ABF2	Q02486	183 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	SML1	Q04964	104 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	MSA1	Q08471	629 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YOR029W	Q12243	111 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YLR126C	Q12288	251 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	CDC8	P00572	216 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	VAR1	P02381	398 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YKL075C	P36083	450 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	RIB1	P38066	345 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	TCD1	P38756	429 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	TIR3	P40552	269 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	BNA6	P43619	295 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	MRPL50	P53724	139 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YML096W	Q04489	525 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	GPA2	P10823	449 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	MEI4	P29467	408 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YUH1	P35127	236 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	PGD1	P40356	397 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	ICE2	P40499	491 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	HOC1	P47124	396 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	AIF1	P52923	378 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YMD8	Q03697	442 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YML108W	Q03759	105 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	KRE28	Q04431	385 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YLR173W	Q06247	608 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	PAM18	Q07914	168 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YPL229W	Q99395	206 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	FZF1	P32805	299 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	CUE1	P38428	203 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	RRT8	Q08219	342 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	ATG31	Q12421	196 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	QCR8	P08525	94 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	MRPS28	P21771	286 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	MRPL25	P23369	157 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	SRB4	P32569	687 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YNL217W	P40152	326 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	PEX17	P40155	199 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	MCM22	P47167	239 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	TRM9	P49957	279 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	BOL2	P53082	120 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	DID2	P69771	204 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	TRM12	Q04235	462 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	MED4	Q12343	284 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	PSF1	Q12488	208 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	MET5	P47169	1442 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	ATG22	P25568	528 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	DOG2	P38773	246 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YRB2	P40517	327 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YJR149W	P47177	404 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	NUP84	P52891	726 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	SAY1	P53324	424 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	LPP1	Q04396	274 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	YPL162C	Q12042	273 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YJL135W	YJL135W	DRS2	P39524	1355 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	REP2	P03872	296 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YET1	P35723	206 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	LDB7	P38210	180 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	GAA1	P39012	614 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	IRC22	P40006	225 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YER076C	P40049	302 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	FMC1	P40491	155 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	UBC7	Q02159	165 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	SRL4	Q03085	281 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	SNZ1	Q03148	297 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YMR007W	Q03675	126 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	ANT1	Q06497	328 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YLR156W	P0CE96	114 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YLR159W	P0CE97	114 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YLR161W	P0CE98	114 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	MRPL28	P36527	147 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	POP4	P38336	279 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	DOC1	P53068	250 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YNR077C	P53758	84 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.57	□□□□□ -2.32	not detected
YJL135W	YJL135W	PET117	Q02771	107 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YDR248C	Q03786	193 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	TSC3	Q3E790	80 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	TUS1	Q06412	1307 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	INO80	P53115	1489 aa		0.56	□□□□□ -2.32

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