RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	PET191	Q02772	108 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	OSW1	Q08692	278 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	PEX11	Q12462	236 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	MDM10	P18409	493 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YNL184C	P53876	108 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YNL046W	P53956	172 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	MIM1	Q08176	113 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	STE7	P06784	515 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	URA10	P30402	227 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	OMA1	P36163	345 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	CFD1	P40558	293 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	FAR7	P43592	221 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	APS3	P47064	194 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SWP1	Q02795	286 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	CSN9	Q03981	162 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YOR186W	Q08560	144 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YOR292C	Q08743	309 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	APS1	P35181	156 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	PEX17	P40155	199 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	EGT2	P42835	1041 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	AIM25	P47140	327 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	MRH4	P53166	561 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	CRZ1	P53968	678 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	HSK3	P69852	69 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SLM6	P38343	150 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	ARN2	P38724	620 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YMR254C	Q04838	102 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	FDH1	Q08911	376 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	ATP16	Q12165	160 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SWI1	P09547	1314 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	CYC3	P06182	269 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	EPT1	P22140	391 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	PRY2	P36110	329 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	NAT2	P37293	288 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YIL067C	P40514	678 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	PHB1	P40961	287 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	PLP1	Q04004	230 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	MDM32	Q12171	622 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	MHT1	Q12525	324 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	ATR1	P13090	542 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SOL2	P37262	315 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SPL2	P38839	148 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SHY1	P53266	389 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	RSC9	Q03124	581 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	HMS1	Q12398	434 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	TRM10	Q12400	293 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	CDC8	P00572	216 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	AVT7	P40501	490 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	HAC1	P41546	238 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SNO3	P43544	222 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SDS23	P53172	527 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	PRM8	P53174	237 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	ADD37	Q03233	198 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	MSA1	Q08471	629 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YPL257W	Q08974	193 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	ATX2	Q12067	313 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YLR046C	Q12253	270 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	PMU1	P36069	295 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	FRM2	P37261	193 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SCO2	P38072	301 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	GLE2	P40066	365 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	RRG9	P40156	214 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SCS3	P53012	380 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	FLC3	P53121	802 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SUN4	P53616	420 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	RMI1	Q02685	241 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	FSH2	Q05015	223 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	FCY2	P17064	533 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	AHC2	P25649	128 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	LDS1	P31379	325 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	PEX2	P32800	271 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86

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