RNA–Protein interactions for RNA: YJL050W

MTR4, Transcript of ATP-dependent 3'-5' RNA helicase of the DExD/H family, yeast

Gene MTR4, Length 3,222 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR4	YJL050W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	RER1	P25560	188 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	AGA2	P32781	87 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TKL2	P33315	681 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SAF1	P38352	637 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	PNT1	P38969	423 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YEA4	P40004	342 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YFR020W	P43600	232 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TNA1	P53322	534 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	CYC7	P00045	113 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	CDC21	P06785	304 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YCR025C	P25352	136 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	HXT4	P32467	576 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YEL073C	P39974	107 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	AMA1	P50082	593 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	RUB1	Q03919	77 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	STP3	Q05937	343 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	PAU16	P35994	123 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SCS3	P53012	380 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	ROY1	Q04847	553 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YOR365C	Q08844	703 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	LAS17	Q12446	633 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SOD2	P00447	233 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	GAL2	P13181	574 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YCR007C	P25354	239 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	DCG1	P32460	244 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	FIG1	P38224	298 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YNL195C	P40168	261 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	LRO1	P40345	661 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	NEO1	P40527	1151 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	EMC4	P53073	190 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	THI74	Q04083	370 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YMR082C	Q04276	118 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	PUS5	Q06244	254 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	PIN2	Q12057	282 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	ERV2	Q12284	196 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YSR3	P23501	404 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SRP21	P32342	167 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SSH4	P32343	579 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	ISF1	P32488	338 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TCA17	P32613	152 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YJL068C	P40363	299 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	COG7	P53195	279 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	UPS3	Q04006	179 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YDR444W	Q04093	687 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	NAT4	Q04751	285 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YLR012C	Q07927	99 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YOR114W	Q12219	294 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	ORT1	Q12375	292 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	PET20	Q99373	253 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	QCR2	P07257	368 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	HVG1	P0CE11	249 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	HAP3	P13434	144 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SLY41	P22215	453 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TRX3	P25372	127 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	AHT1	P29589	182 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SKN1	P33336	771 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	KKQ8	P36004	724 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	RMD8	P43620	662 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	COQ11	Q05892	277 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YKL075C	P36083	450 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	UBX6	P47049	396 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	MET31	Q03081	177 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TMN2	Q04562	672 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YCT1	Q12235	531 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	HIP1	P06775	603 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SAC7	P17121	654 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	RPB5	P20434	215 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	NFS1	P25374	497 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	VMA3	P25515	160 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YKL069W	P36088	180 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TAE1	P38340	232 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YBR292C	P38357	123 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	CIN2	P46670	268 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	EAF6	P47128	113 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YGR042W	P53227	271 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	MRP51	Q02950	344 aa		3.1	□□□□□ -1.91

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