RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W PAM16P42949 149 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W NUP57P48837 541 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W AVT4P50944 713 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YGL114WP53134 725 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W CYT2Q00873 224 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YSA1Q01976 231 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YPL067CQ02754 198 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W FRQ1Q06389 190 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W GRC3Q07845 632 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W NDD1Q08887 554 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YPL272CQ08984 517 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W UNG1P12887 359 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W PRE1P22141 198 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W AAT2P23542 418 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W OAC1P32332 324 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W CLB6P32943 380 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W HMT1P38074 348 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W LDB7P38210 180 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W DBP8P38719 431 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MMF1P40185 145 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W FLX1P40464 311 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ICE2P40499 491 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SAY1P53324 424 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SAM50P53969 484 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MSC1Q03104 513 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W AIM32Q04689 311 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W TVP18Q04767 167 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YPQ1Q12010 308 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W PEX11Q12462 236 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YNR034W-AQ3E841 98 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SCH9P11792 824 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SPO7P18410 259 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MRP17P28778 131 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W EHD3P28817 500 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MSK1P32048 576 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SPS19P32573 292 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ANS1P38832 159 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YEL073CP39974 107 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YND1P40009 630 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W AYR1P40471 297 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W GAB1P41733 394 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ATG27P46989 271 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YJR149WP47177 404 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MRX6P48564 524 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SOL1P50278 321 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ERG26P53199 349 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YDR366CP87287 132 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SHH3Q04487 196 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W RNH202Q05635 350 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YLR446WQ06204 433 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W RDR1Q08904 546 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SRO7Q12038 1033 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W TFC7Q12415 435 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W PRM4Q12498 284 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W IRA2P19158 3079 aa3.43□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W HAP2P06774 265 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ATP5P09457 212 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W CAT5P41735 233 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W PFS2P42841 465 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ALK1P43633 760 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YJR012CP47087 207 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W VEL1P53058 206 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MDM34P53083 459 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W TIM21P53220 239 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SAE3P89114 91 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W PIR1Q03178 341 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W DCI1Q08558 271 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YPR011CQ12251 326 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YOP1Q12402 180 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W AHC1Q12433 566 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YLR099W-AQ3E798 87 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W COA6Q3E846 104 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W INH1P01097 85 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SGA1P08019 549 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W RIP1P08067 215 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W EPT1P22140 391 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W PRE7P23724 241 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W GEX1P25596 615 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W PEX4P29340 183 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ERG1P32476 496 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W TCA17P32613 152 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MGM101P32787 269 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W NTF2P33331 125 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SFK1P35735 353 aa3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data3.42□□□□□ -1.86not detected
HCA4YJL033W TCD2P36101 447 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YBR096WP38256 230 aa3.42□□□□□ -1.86
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