RNA–Protein interactions for RNA: YHR193C

EGD2, Transcript of Alpha subunit of the nascent polypeptide-associated complex (NAC), yeast

Gene EGD2, Length 525 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EGD2	YHR193C	SDH4	P37298	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	SDP1	P40479	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	MRX5	P47007	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	SSN8	P47821	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	YGR016W	P53209	190 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	MDM10	P18409	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	ATG22	P25568	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	OAC1	P32332	324 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	EFM3	P47163	339 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	YIP1	P53039	248 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	YGR151C	P53287	111 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	YNL234W	P53857	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	SCW10	Q04951	389 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	MDM36	Q06820	579 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	PRM3	Q08931	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	VAM3	Q12241	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EGD2	YHR193C	REP2	P03872	296 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	UBC8	P28263	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	UTR5	P32630	166 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	CPR5	P35176	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	YKL075C	P36083	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	CAB4	P53332	305 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	HOF1	Q05080	669 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	WHI5	Q12416	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	HUT1	Q12520	339 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	YCR061W	P25639	631 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	MTC2	P34246	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	GET2	P40056	285 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	YJL213W	P40896	331 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	SWP82	P43554	623 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	YGL262W	P53054	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	BUD17	P53727	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	HOT1	Q03213	719 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	MSC3	Q05812	728 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	COX2	P00410	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	AGP3	P43548	558 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	HSK3	P69852	69 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	JID1	Q12350	301 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	ATG40	Q99325	256 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	PET122	P10355	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	ERG2	P32352	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	ECM27	P47144	725 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	POP6	P53218	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	SRL4	Q03085	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	SPC24	Q04477	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	VCX1	Q99385	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	SDS22	P36047	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	FLO10	P36170	1169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	MRPL36	P36531	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	MDM31	P38880	579 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	YMD8	Q03697	442 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	YHP1	Q04116	353 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	SMP3	Q04174	516 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	PEX30	Q06169	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	OSW1	Q08692	278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	YCR101C	P25607	182 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	PEX4	P29340	183 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	RCN1	P36054	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EGD2	YHR193C	SHE1	P38200	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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