RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	MSS11	Q03825	758 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	GAS2	Q06135	555 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	CTS2	Q06350	511 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	MRPL35	Q06678	367 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	TMS1	Q12116	473 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	COX17	Q12287	69 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
CPR4	YCR069W	PET54	P10834	293 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	GCN3	P14741	305 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	CDC23	P16522	626 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	MDH2	P22133	377 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	PPA2	P28239	310 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	ERG9	P29704	444 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	AFG1	P32317	509 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	FLO5	P38894	1075 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SWM2	P40342	146 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	IDP2	P41939	412 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	AIM25	P47140	327 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	BRR6	P53062	197 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	DOC1	P53068	250 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	MRH4	P53166	561 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	POP6	P53218	158 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	ERV29	P53337	310 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	PHO92	Q06390	306 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	RAF1	Q06891	181 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	PEX27	Q08580	376 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	ATG41	Q12048	136 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SCM3	Q12334	223 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	ORT1	Q12375	292 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	HMS1	Q12398	434 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	IZH2	Q12442	317 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YCR061W	P25639	631 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	RIB7	P33312	244 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YBR242W	P38331	238 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YEL057C	P39983	233 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YNR048W	P53740	393 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YDL242W	Q07746	117 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	RFU1	Q08003	200 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	DSF1	P0CX08	502 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YNR073C	P0CX09	502 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	STE18	P18852	110 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	IFM1	P25038	676 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YCR101C	P25607	182 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	COS9	P36034	407 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	HPA3	P39979	161 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	AVT7	P40501	490 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	NAS2	P40555	220 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	RCE1	Q03530	315 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YMR252C	Q04814	134 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	KEI1	Q06346	221 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YDL218W	Q07629	317 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YOR385W	Q08909	290 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	ISA2	Q12425	185 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	PRM4	Q12498	284 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	SPS2	P08459	502 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	HXT2	P23585	541 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	SRL3	P36167	246 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	LAG1	P38703	411 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	GPI16	P38875	610 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	BMT5	P40493	336 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	CIN2	P46670	268 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	CTK2	P46962	323 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	VHT1	P53241	593 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	ACS1	Q01574	713 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YDR102C	Q03864	110 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YRM1	Q12340	786 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	HEM4	P06174	275 aa		3.93	□□□□□ -1.78

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