RNA–Protein interactions for RNA: YBR169C

SSE2, Transcript of Member of the heat shock protein 70 (HSP70) family, yeast

Gene SSE2, Length 2,082 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSE2	YBR169C	DCI1	Q08558	271 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	TMS1	Q12116	473 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	YLR108C	Q12259	485 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	PCC1	Q3E833	88 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
SSE2	YBR169C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	NAM2	P11325	894 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	SAG1	P20840	650 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	STP22	P25604	385 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	BUB3	P26449	341 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	IKI1	P38874	309 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	SRP14	P38985	146 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	ERG28	P40030	148 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	SHO1	P40073	367 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	POP1	P41812	875 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	YJR012C	P47087	207 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	ECM27	P47144	725 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	TRM9	P49957	279 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	AVT4	P50944	713 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	AIF1	P52923	378 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	YGL185C	P53100	379 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	JAC1	P53193	184 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	PAM18	Q07914	168 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	FDH1	Q08911	376 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	YPL199C	Q08954	240 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	YLR046C	Q12253	270 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	SLO1	Q3E784	85 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	CSF1	Q12150	2958 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	QCR7	P00128	127 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	PHO2	P07269	559 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	RIP1	P08067	215 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	SRB6	P32570	121 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	FRE2	P36033	711 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	CHL4	P38907	458 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	HEM14	P40012	539 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	COX15	P40086	486 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	PAN6	P40459	309 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	SPG5	P42933	373 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	YCH1	P42937	148 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	HIT1	P46973	164 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	NUP57	P48837	541 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	SPP2	Q02521	185 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	YMR130W	Q04223	302 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	RNH202	Q05635	350 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	MRPL35	Q06678	367 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	BSC1	Q12140	328 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	JLP1	Q12358	412 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	ATP5	P09457	212 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	CUP2	P15315	225 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	PPH21	P23594	369 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	YCL068C	P25593	260 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	TRS65	P32893	560 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	ASK1	P35734	292 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	YKL075C	P36083	450 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	YKL071W	P36086	256 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	MED6	P38782	295 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	GAT2	P40209	560 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	SFH5	P47008	294 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	YPL067C	Q02754	198 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	ATG10	Q07879	167 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	TFC7	Q12415	435 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	RIB3	Q99258	208 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SSE2	YBR169C	VPS63	O13549	108 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	COX2	P00410	251 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	PEX34	P25584	144 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	PPA2	P28239	310 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	PDC2	P32896	925 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	HIS2	P38635	335 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	YHR035W	P38769	630 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	ALP1	P38971	573 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	FAA2	P39518	744 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	GWT1	P47026	490 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	DAN1	P47178	298 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	MKC7	P53379	596 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	YNL260C	P53846	198 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SSE2	YBR169C	TDA1	Q03533	586 aa		2.96	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.8 ms