RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	YHR033W	P38690	423 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	DBP8	P38719	431 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YHK8	P38776	514 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	AYR1	P40471	297 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	HAC1	P41546	238 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
VBA1	YMR088C	IBD2	P53892	351 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YML018C	Q03730	393 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	FMN1	Q03778	218 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	POM34	Q12445	299 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SPE4	Q12455	300 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	UBA3	Q99344	299 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	DNF1	P32660	1571 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	ALG7	P07286	448 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SGA1	P08019	549 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
VBA1	YMR088C	PDE1	P22434	369 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SCO1	P23833	295 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	FRM2	P37261	193 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YBR032W	P38223	100 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MMS21	P38632	267 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	CHS7	P38843	316 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MIT1	P40002	666 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	FIS1	P40515	155 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YIL024C	P40543	189 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	TAD1	P53065	400 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PRM6	Q04705	352 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	AFT2	Q08957	416 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YOR342C	Q12182	319 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PRR2	Q12310	699 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	ATG5	Q12380	294 aa		5	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SUC2	P00724	532 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YCL002C	P25565	263 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	INO2	P26798	304 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YBR053C	P38235	358 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PNT1	P38969	423 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	BMT5	P40493	336 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	AZF1	P41696	914 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PRY1	P47032	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	XPT1	P47165	209 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	GLO1	P50107	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SUR7	P54003	302 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	HHT1	P61830	136 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	RHO4	Q00246	291 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	TSA2	Q04120	196 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	DIC1	Q06143	298 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	AIM39	Q08223	395 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	HNT3	Q08702	217 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SNF4	P12904	322 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	FCY2	P17064	533 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	FUB1	P25659	250 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PPZ2	P33329	710 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YER076C	P40049	302 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YFL040W	P43562	540 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SSY5	P47002	699 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	TAX4	P47030	604 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	BUL1	P48524	976 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YIP1	P53039	248 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	CDH1	P53197	566 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	FRE4	P53746	719 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MRX8	Q05473	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	LIP2	Q06005	328 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	ENT4	Q07872	247 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	LDS2	Q08218	356 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PFA4	Q12006	378 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YDR215C	Q12240	137 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	ERP3	Q12403	225 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MHT1	Q12525	324 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MGT1	P26188	188 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	TOS1	P38288	455 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	CUE1	P38428	203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	FAA2	P39518	744 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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