RNA–Protein interactions for RNA: YMR031C

EIS1, Transcript of Component of the eisosome required for proper eisosome assembly, yeast

Gene EIS1, Length 2,532 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EIS1	YMR031C	FRE8	Q12209	686 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	SAL1	D6W196	494 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	ERG11	P10614	530 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	FCY2	P17064	533 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	SEC22	P22214	214 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.61	RIP-Chip
EIS1	YMR031C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	ECM15	P35195	104 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	ETR1	P38071	380 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	DBP8	P38719	431 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	XBP1	P40489	647 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	YPS6	P40583	537 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	YJL043W	P47053	257 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	IRC18	P47056	224 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	UBC12	P52491	188 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	LST7	P53237	242 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	MKC7	P53379	596 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	IBD2	P53892	351 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	TPP1	Q03796	238 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	SDH7	Q04401	133 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	ATX2	Q12067	313 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EIS1	YMR031C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	CDC20	P26309	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	MRPL3	P36516	390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	YPC1	P38298	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	CHL4	P38907	458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	NSG2	P53898	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	APS2	Q00381	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	TMA10	Q06177	86 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	IRC10	Q08118	586 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	PEX27	Q08580	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	YIL177C	P40434	1758 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	YJL225C	P40889	1758 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	KRE5	P22023	1365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	RAD10	P06838	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	SNF5	P18480	905 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	PPH21	P23594	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	RNP1	P32385	249 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	DCG1	P32460	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	YKR075C	P36155	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	GAT2	P40209	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	SKP1	P52286	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	SLM2	P53955	656 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	FRE7	Q12333	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	ECM3	Q99252	613 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	DNF3	Q12674	1656 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	COR1	P07256	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	RPB8	P20436	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	MSK1	P32048	576 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	PRO1	P32264	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	SEC17	P32602	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	RTG1	P32607	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	DRE2	P36152	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	UBX6	P47049	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	GOT1	Q03554	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	INP1	Q03694	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	TRM12	Q04235	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	NKP2	Q06162	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
EIS1	YMR031C	PEX11	Q12462	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	YBR144C	P34215	104 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	YBR053C	P38235	358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	IST2	P38250	946 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	LEU5	P38702	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	CDH1	P53197	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	SWC4	P53201	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
EIS1	YMR031C	PET191	Q02772	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	RSC9	Q03124	581 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	RPB5	P20434	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	MRPL28	P36527	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	MID1	P41821	548 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	COS10	P52924	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	YGR168C	P53293	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	YNR048W	P53740	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	YLR152C	P54072	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	SEN15	Q04675	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EIS1	YMR031C	ARR3	Q06598	404 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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