RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIR3	YKL163W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	HOT13	P36078	116 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YBR241C	P38142	488 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	MST28	P39552	234 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	ALG8	P40351	577 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	ICE2	P40499	491 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	AGE2	P40529	298 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	SBH2	P52871	88 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	MMS2	P53152	137 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	PEX31	P53203	462 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	POP6	P53218	158 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YLR460C	P54007	376 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YMR181C	Q03231	154 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	ARO80	Q04052	950 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YPR098C	Q06089	161 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	PFA4	Q12006	378 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	IFM1	P25038	676 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	GIT1	P25346	518 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	CSG2	P35206	410 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	SPC34	P36131	295 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	DER1	P38307	211 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	KRE29	P40026	464 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	RTS2	P40962	232 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	GWT1	P47026	490 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YJR056C	P47115	236 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YGL235W	P53071	178 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	ALG13	P53178	202 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	COG7	P53195	279 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	SUR7	P54003	302 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	CDC14	Q00684	551 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	SNO1	Q03144	224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YET2	Q04210	160 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	ECI1	Q05871	280 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YDL114W	Q07530	308 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YEH2	Q07950	538 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YNG1	Q08465	219 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YDR018C	Q12185	396 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YLR046C	Q12253	270 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	PCL9	Q12477	304 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	PRM4	Q12498	284 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	PET20	Q99373	253 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	SPT3	P06844	337 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	RPL43B	P0CX26	92 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	CPR3	P25719	182 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	COQ3	P27680	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YCR087C-A	P37263	153 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YPC1	P38298	316 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
PIR3	YKL163W	COX14	P39103	70 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	JLP2	P40206	208 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	EMC4	P53073	190 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YGL204C	P53089	101 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	CDH1	P53197	566 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YLR152C	P54072	576 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	PIR1	Q03178	341 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	RSM10	Q03201	203 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	HNT3	Q08702	217 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	RSA1	Q08932	381 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	not detected
PIR3	YKL163W	PPH21	P23594	369 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	AVT5	P38176	459 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	MET30	P39014	640 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	VPS52	P39904	641 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YEL075C	P39972	122 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	NBP35	P52920	328 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YPS5	P53057	165 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	VHT1	P53241	593 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	ABF2	Q02486	183 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YDC1	Q02896	317 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	DPP1	Q05521	289 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YLR446W	Q06204	433 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	ATG10	Q07879	167 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	RPN6	Q12377	434 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	EMP46	Q12396	444 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	YLR111W	Q12528	110 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	MGT1	P26188	188 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	PMT2	P31382	759 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PIR3	YKL163W	PDC2	P32896	925 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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