RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W PLB3Q08108 686 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W JLP1Q12358 412 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MRX4Q12467 430 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W PSF1Q12488 208 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RPC40P07703 335 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W CPR4P25334 318 aa3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W AHC2P25649 128 aa3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ASC1P38011 319 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W HTD2P38790 280 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W AIM10P39965 576 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W GLC8P41818 229 aa3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YJR056CP47115 236 aa3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YJR111CP47148 283 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MEP3P53390 489 aa3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MPA43P53583 542 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W GPI15P53961 229 aa3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W RHO4Q00246 291 aa3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W EKI1Q03764 534 aa3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YMR087WQ04299 284 aa3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W DCR2Q05924 578 aa3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W RFU1Q08003 200 aa3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa3.46□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SIR2P06700 562 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W HIP1P06775 603 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W CKA1P15790 372 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ERD2P18414 219 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ZRC1P20107 442 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ADH7P25377 361 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W VPH1P32563 840 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W TIM17P39515 158 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W GAT2P40209 560 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W BMT5P40493 336 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YIL060WP40519 144 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W LOH1P47055 219 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MRP51Q02950 344 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YDR056CQ12025 205 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W PST1Q12355 444 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YIL134C-AQ45U18 67 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ADH2P00331 348 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W HEM2P05373 342 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SEC62P21825 274 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data3.45□□□□□ -1.86not detected
HCA4YJL033W GSP1P32835 219 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W GSP2P32836 220 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SNC2P33328 115 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YBR063CP38083 404 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YHR035WP38769 630 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W LOC1P43586 204 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YHC3P47040 408 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W CCC1P47818 322 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W PHB2P50085 310 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W VOA1P53262 265 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SYF2P53277 215 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W FMP41P53889 259 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YNL143CP53908 130 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W STD1Q02794 444 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W RSF1Q05043 376 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MFG1Q07684 458 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W FDH1Q08911 376 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ATG41Q12048 136 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W TMS1Q12116 473 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SFG1Q12507 346 aa3.45□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W TAO3P40468 2376 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SPT3P06844 337 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ADH3P07246 375 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W PRB1P09232 635 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YOL163WP0CF20 169 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MET8P15807 274 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W PDX1P16451 410 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SEC59P20048 519 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SEC22P22214 214 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ATG15P25641 520 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W RTC2P38279 296 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W PHO90P39535 881 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ELO1P39540 310 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W HXT14P42833 540 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W DLD2P46681 530 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W HMS2P47175 358 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W COS10P52924 374 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W ASI3P53983 676 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W LDB18Q07887 179 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W YJR112W-AQ3E743 109 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W PET18P25362 215 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SEC17P32602 292 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W COS9P36034 407 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W DOA1P36037 715 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W MRPL4P36517 319 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W CBP4P37267 147 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SRO77P38163 1010 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W LRP1P38801 184 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W HAT2P39984 401 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W GIM4P40005 111 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W FMC1P40491 155 aa3.44□□□□□ -1.86
HCA4YJL033W SSU1P41930 458 aa3.44□□□□□ -1.86
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