RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	MDM32	Q12171	622 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	GCN4	P03069	281 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	NPL6	P32832	435 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SHO1	P40073	367 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	PUG1	P40100	303 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YIL024C	P40543	189 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SYS1	P41544	203 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	IKS1	P47042	667 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YJR120W	P47157	116 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	RPN14	P53196	417 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YGR066C	P53242	292 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SAM50	P53969	484 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YLR152C	P54072	576 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.01	□□□□□ -1.77	not detected
CPR4	YCR069W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	AIM36	Q03798	255 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	MIX14	Q04341	121 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	BTS1	Q12051	335 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	OPI3	P05375	206 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	RPB8	P20436	146 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	DBF2	P22204	572 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	ARO7	P32178	256 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SPT14	P32363	452 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	RCN1	P36054	211 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SDS24	P38314	527 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	LNP1	P38878	278 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	DLS1	P40366	167 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YFR054C	P43622	192 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	IRC18	P47056	224 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	BSC5	P53755	489 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	NRK1	P53915	240 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	RSM23	Q01163	450 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SRL2	Q12020	392 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	HFA1	P32874	2273 aa		4	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	FLO9	P39712	1322 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	HIS3	P06633	220 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	PHO2	P07269	559 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	CHO1	P08456	276 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	MAK32	P23060	363 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	BOS1	P25385	244 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	PDR3	P33200	976 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SNC2	P33328	115 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	ZRT3	P34240	503 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	CLG1	P35190	452 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	MRPL3	P36516	390 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	FRM2	P37261	193 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	PEX32	P38292	413 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	LOH1	P47055	219 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	MSY1	P48527	492 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	PCP1	P53259	346 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YDR391C	Q04170	232 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	ASR1	Q06834	288 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	HRT1	Q08273	121 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YDL180W	Q12301	547 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	FSH3	Q99369	266 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	KIN28	P06242	306 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	CTA1	P15202	515 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	ADH7	P25377	361 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	COQ3	P27680	312 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YMR262W	P38430	313 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YHK8	P38776	514 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SAY1	P53324	424 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	AAH1	P53909	347 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	HHT1	P61830	136 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	MRPS16	Q02608	121 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	CTF19	Q02732	369 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	KAP120	Q02932	1032 aa		3.98	□□□□□ -1.77

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