RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	TRM12	Q04235	462 aa		5.05	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	HRD3	Q05787	833 aa		5.05	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		5.05	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	IZH4	Q99393	312 aa		5.05	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	TPK2	P06245	380 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	YFL068W	P0CX99	160 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	BUB3	P26449	341 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	PDC2	P32896	925 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	YET1	P35723	206 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	YHL044W	P38727	235 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	DOG1	P38774	246 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	YAL037W	P39728	267 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	YER189W	P40104	122 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	PAN6	P40459	309 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	PTR3	P43606	678 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	RPA43	P46669	326 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	ZAP1	P47043	880 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	IRC8	P47046	822 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	EXG2	P52911	562 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	BUD9	P53226	547 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	RXT3	Q07458	294 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	SHS1	Q07657	551 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	YCT1	Q12235	531 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	GEP5	Q12393	293 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	PHO80	P20052	293 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	LSB5	P25369	354 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	YOR062C	P36025	268 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	YNL320W	P42840	284 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	BNA2	P47125	453 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	HSP31	Q04432	237 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	TDA6	Q06466	467 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	MCH1	Q07376	486 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	FRE8	Q12209	686 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VBA1	YMR088C	HIP1	P06775	603 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	CTA1	P15202	515 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SNC1	P31109	117 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	REC104	P33323	182 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SGE1	P33335	543 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MRPL36	P36531	177 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YBL029W	P38201	376 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YHR210C	P38893	341 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	HPA3	P39979	161 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	KRE29	P40026	464 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YIL060W	P40519	144 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MEP2	P41948	499 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YNL092W	P53934	400 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	IZH1	Q03419	316 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	IRC13	Q08630	104 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	RAD28	Q12021	506 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	COA6	Q3E846	104 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YLR462W	O13556	202 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	STE4	P18851	423 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	RPB5	P20434	215 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	EPT1	P22140	391 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
VBA1	YMR088C	YKL107W	P34251	309 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	EHT1	P38295	451 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YHR130C	P38834	111 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	FKH2	P41813	862 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	HNT2	P49775	206 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	NIF3	P53081	288 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	NMA2	P53204	395 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	UPS3	Q04006	179 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YLR224W	Q05947	369 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YDL177C	Q12257	170 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PST1	Q12355	444 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	BPT1	P14772	1559 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	CDC6	P09119	513 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	TIR1	P10863	254 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SYN8	P31377	255 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	DCG1	P32460	244 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	FMT1	P32785	401 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	NNK1	P36003	928 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.4 ms