RNA–Protein interactions for RNA: YML125C

PGA3, Transcript of Putative cytochrome b5 reductase, localized to the plasma membrane, yeast

Gene PGA3, Length 939 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PGA3	YML125C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	ITR1	P30605	584 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	RCN1	P36054	211 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	PEX10	Q05568	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	TPO3	Q06451	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	YDL180W	Q12301	547 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	COX5B	P00425	151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	PHO2	P07269	559 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	CAP2	P13517	287 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	PCL1	P24867	279 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	SED4	P25365	1065 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	PRE4	P30657	266 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	MRPL39	P36533	70 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	FRM2	P37261	193 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	MTC6	P38849	526 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	MSS4	P38994	779 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	HPA3	P39979	161 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	PUG1	P40100	303 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	DLS1	P40366	167 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	BNA6	P43619	295 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	LOH1	P47055	219 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	YIP4	P53093	235 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	MRPL19	P53875	158 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	YAP6	Q03935	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	PEX30	Q06169	523 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	CNE1	P27825	502 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	RIB7	P33312	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	SEC66	P33754	206 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	ALG14	P38242	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	AIM20	P40451	204 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	POP6	P53218	158 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	SLI1	P53304	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	AAH1	P53909	347 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	RAF1	Q06891	181 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	HEM25	Q07534	307 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	FRE3	Q08905	711 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	MCT1	Q12283	360 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	ORT1	Q12375	292 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	SGA1	P08019	549 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	NAM2	P11325	894 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	KRE6	P32486	720 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	PPG1	P32838	368 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	SNC2	P33328	115 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	CLG1	P35190	452 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	TAT1	P38085	619 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	YMR262W	P38430	313 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	XBP1	P40489	647 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	CIN2	P46670	268 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	NIT3	P49954	291 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	TPN1	P53099	579 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	NRK1	P53915	240 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	RSM23	Q01163	450 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	THI72	Q08579	599 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	INP53	Q12271	1107 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	ISA2	Q12425	185 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	TRA1	P38811	3744 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	PET18	P25362	215 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	ATG15	P25641	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	HYM1	P32464	399 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	MRPS5	P33759	307 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	YBR096W	P38256	230 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	IDP2	P41939	412 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	CTK2	P46962	323 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	MSE1	P48525	536 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	PHB2	P50085	310 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	FMP48	P53233	369 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	VHT1	P53241	593 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	TNA1	P53322	534 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	BUD25	P85052	153 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PGA3	YML125C	RCE1	Q03530	315 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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