RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	CRC1	Q12289	327 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	SUL2	Q12325	893 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	DGK1	Q12382	290 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ISN1	Q99312	450 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	MPD2	Q99316	277 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	HOM3	P10869	527 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	APA2	P22108	325 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	BOS1	P25385	244 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	CNE1	P27825	502 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	VAM7	P32912	316 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YKL162C	P36052	402 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	FAT1	P38225	669 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	MET30	P39014	640 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	MRX5	P47007	382 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	MCM22	P47167	239 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	PHB2	P50085	310 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YIP4	P53093	235 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	FLC3	P53121	802 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	VHT1	P53241	593 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	CAC2	Q04199	468 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	NAT4	Q04751	285 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ROY1	Q04847	553 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	AHC1	Q12433	566 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	PHO2	P07269	559 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	GPI12	P23797	304 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ADE1	P27616	306 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	SSH4	P32343	579 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	MCM10	P32354	571 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	MAL32	P38158	584 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	PGD1	P40356	397 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	UBX6	P47049	396 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YGL235W	P53071	178 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YGL204C	P53089	101 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	CGR1	P53188	120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	COG7	P53195	279 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	MAL12	P53341	584 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	NRK1	P53915	240 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	BNA7	Q04066	261 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	RRI1	Q12468	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	GAL1	P04385	528 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	CHO1	P08456	276 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	RPB5	P20434	215 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	PEX32	P38292	413 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YPC1	P38298	316 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ECM34	P38728	170 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
TVP38	YKR088C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	POG1	P40473	351 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YIL060W	P40519	144 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	BUD8	P41698	603 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YHC3	P47040	408 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	SSN8	P47821	323 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	MMT2	Q08970	484 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	VPS68	Q12016	184 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	TFC7	Q12415	435 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	PRM4	Q12498	284 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	HIP1	P06775	603 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ZRC1	P20107	442 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	CDS1	P38221	457 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	SDS24	P38314	527 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	LNP1	P38878	278 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	SYS1	P41544	203 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	OTU1	P43558	301 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	MOG1	P47123	218 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	SRB7	P47822	140 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YGR042W	P53227	271 aa		4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.1 ms