RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	SCEI	P03882	235 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	PHO2	P07269	559 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	PRB1	P09232	635 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	MCM10	P32354	571 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	FRM2	P37261	193 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	SLZ1	P40167	298 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	CIN2	P46670	268 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	AAH1	P53909	347 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YPL039W	Q03080	316 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	MCH4	Q08268	501 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YPL272C	Q08984	517 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	SRL2	Q12020	392 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	SWM1	Q12379	170 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YBR085C-A	O43137	85 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	SGA1	P08019	549 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	PUT1	P09368	476 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	SPO7	P18410	259 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YCR061W	P25639	631 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	LYS5	P50113	272 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	UBC12	P52491	188 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	BSC5	P53755	489 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	NRK1	P53915	240 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YML108W	Q03759	105 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YOR376W	Q08900	122 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	TGS1	Q12052	315 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YRM1	Q12340	786 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YLR358C	O13565	187 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	NAM2	P11325	894 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	SHO1	P40073	367 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	NIT3	P49954	291 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YGR066C	P53242	292 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.31	□□□□□ -1.24	not detected
GGA2	YHR108W	AEP3	Q12089	606 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	DAL82	P21705	255 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	FLO10	P36170	1169 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	MRPL36	P36531	177 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	UMP1	P38293	148 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	PUG1	P40100	303 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	REE1	P40893	198 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	BUD8	P41698	603 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	PGU1	P47180	361 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	PMT3	P47190	753 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	TYW3	P53177	273 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	AKR2	Q12013	749 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	PET20	Q99373	253 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	AAC1	P04710	309 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	PDX1	P16451	410 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	SUA5	P32579	426 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	COS9	P36034	407 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.3	□□□□□ -1.24	not detected
GGA2	YHR108W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YDR102C	Q03864	110 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	HNM1	P19807	563 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	CPR4	P25334	318 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	BMT5	P40493	336 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	PHB2	P50085	310 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	MTC7	P32633	139 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	FMT1	P32785	401 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YBL010C	P32788	280 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	PPZ2	P33329	710 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	APD1	P38281	316 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	SOL3	P38858	249 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.28	□□□□□ -1.24	RIP-Chip
GGA2	YHR108W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	RNH201	P53942	307 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	TIM44	Q01852	431 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	ATG21	Q02887	496 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	GIS1	Q03833	894 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	ERG8	P24521	451 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	AFG1	P32317	509 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	MRP20	P32387	263 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	OKP1	P53298	406 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	YML018C	Q03730	393 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	ANT1	Q06497	328 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	MCT1	Q12283	360 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	ATP14	Q12349	124 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
GGA2	YHR108W	TAD2	P47058	250 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GGA2	YHR108W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25

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