RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHS1	YDR247W	AHC2	P25649	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	KRE6	P32486	720 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
VHS1	YDR247W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	FAU1	P40099	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	SNM1	P40993	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	VOA1	P53262	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	OST6	Q03723	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	ATG41	Q12048	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	FRE6	Q12473	712 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	PCL9	Q12477	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	RTC2	P38279	296 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	ATF1	P40353	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	AZF1	P41696	914 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	MNT4	P53745	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	IPK1	Q06667	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	SKS1	Q12505	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	FUN26	P31381	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	SRY1	P36007	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	SSO2	P39926	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	RPE1	P46969	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	AIM25	P47140	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	COS10	P52924	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	EMC4	P53073	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	ROG1	P53118	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	PRM1	P53835	661 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	MTQ1	P53944	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	SAM50	P53969	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	CCE1	Q03702	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	PSF1	Q12488	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	YOS9	Q99220	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	REP2	P03872	296 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	MDM10	P18409	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	EPT1	P22140	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YCR007C	P25354	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
VHS1	YDR247W	PMT2	P31382	759 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SFC1	P33303	322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SKN1	P33336	771 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YHR122W	P38829	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	AIM2	P39721	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SWM2	P40342	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	NUP57	P48837	541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SWC4	P53201	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PAU12	P53343	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	VBA1	Q04301	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	RRN11	Q04712	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	BOP2	Q06150	570 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	RKM5	Q12367	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	RDI1	Q12434	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ARG80	P07249	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ERD1	P16151	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	CDC23	P16522	626 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PDC2	P32896	925 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	VPS17	P32913	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PAU24	P38155	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	NSG1	P38837	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	CHL4	P38907	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	ALP1	P38971	573 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	GGC1	P38988	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	VHS2	P40463	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	CAT5	P41735	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PMT5	P52867	743 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	DOC1	P53068	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	PGA1	P53896	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	OCA2	P53949	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHS1	YDR247W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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