RNA–Protein interactions for RNA: YDL007W

RPT2, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT2, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT2	YDL007W	GPI12	P23797	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	MSS51	P32335	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	MKK1	P32490	508 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	DOA4	P32571	926 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	PAU2	P32612	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	TKL2	P33315	681 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	SNC2	P33328	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	TIP20	P33891	701 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	OAR1	P35731	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	PHO11	P35842	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	MRPL28	P36527	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	PHO12	P38693	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	CHS7	P38843	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YHR177W	P38867	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	EMC5	P40540	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YIR016W	P40572	265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	VPS25	P47142	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	TIM21	P53220	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	PGA1	P53896	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	AAH1	P53909	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	EST3	Q03096	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	SWF1	Q04629	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	ARG7	Q04728	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	TEN1	Q07921	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	FRE6	Q12473	712 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	KIN28	P06242	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	FUN14	P18411	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	EPT1	P22140	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	ORC2	P32833	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	DOA1	P36037	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YEL073C	P39974	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	UBX6	P47049	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	AVT4	P50944	713 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	COG7	P53195	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YGR015C	P53208	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	VHT1	P53241	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YNL143C	P53908	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	FIT1	Q04433	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	BOP2	Q06150	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	AGC1	Q12482	902 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	PRM4	Q12498	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	SEC12	P11655	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	ELF1	P36053	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	MRPL15	P36523	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	EHT1	P38295	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	BUD8	P41698	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	MRX6	P48564	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YGL114W	P53134	725 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YGR042W	P53227	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YNL260C	P53846	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	MMT2	Q08970	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	TGL5	Q12043	749 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	SRN2	Q99176	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	SEC62	P21825	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	BOS1	P25385	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	CNE1	P27825	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	DSS4	P32601	143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	SEF1	P34228	1148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	CBP4	P37267	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	FAU1	P40099	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	FLX1	P40464	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	MET28	P40573	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	PMT6	P42934	759 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	PAC10	P48363	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	TAF4	P50105	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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