RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	RRG9	P40156	214 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SOK1	P40317	901 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MSS2	P40990	351 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RSM10	Q03201	203 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	ABZ2	Q03266	374 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RSN1	Q03516	953 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MDM30	Q05930	598 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SEI1	Q06058	285 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MRPL35	Q06678	367 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YOR376W	Q08900	122 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	HSP42	Q12329	375 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YOL162W	P0CF19	215 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	TFS1	P14306	219 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	ERD2	P18414	219 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	VPH2	P32341	215 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	HSP150	P32478	413 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SBE22	P38814	852 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	COS1	P53822	381 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YLR152C	P54072	576 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	GRX5	Q02784	150 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YMD8	Q03697	442 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YLR345W	Q06137	509 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RCN2	Q12044	265 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YOS9	Q99220	542 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SNF6	P18888	332 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	TIM12	P32830	109 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YME2	P32843	850 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MDL1	P33310	695 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RTC2	P38279	296 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	GOS1	P38736	223 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	APE4	P38821	490 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	IPT1	P38954	527 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	AVT6	P40074	448 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	IRC6	P43615	237 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YFR054C	P43622	192 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SHE4	P51534	789 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YGL235W	P53071	178 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SPO19	Q03029	223 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	ELP6	Q04868	273 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	DCR2	Q05924	578 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YLR446W	Q06204	433 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	ATG17	Q06410	417 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RAX1	Q08760	435 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SPC3	Q12133	184 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SIA1	Q12212	622 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RBD2	Q12270	262 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	APC2	Q12440	853 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MED11	Q99278	115 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	GCN4	P03069	281 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	ERD1	P16151	362 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YPK2	P18961	677 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MRPS28	P21771	286 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	OAC1	P32332	324 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	ECM4	P36156	370 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	OM14	P38325	134 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	KRE29	P40026	464 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SER3	P40054	469 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	POP6	P53218	158 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YGR066C	P53242	292 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YNR062C	P53748	327 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	HXT11	P54862	567 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SNZ1	Q03148	297 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	DML1	Q03652	475 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YPR127W	Q06494	345 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	UIP4	Q08926	304 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YPL278C	Q08990	100 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YDL109C	Q12103	647 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	TRM10	Q12400	293 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MET17	P06106	444 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MET2	P08465	486 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RAD51	P25454	400 aa		3.61	□□□□□ -1.83

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