RNA–Protein interactions for RNA: YPL212C

PUS1, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS1, Length 1,635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS1	YPL212C	NUP1	P20676	1076 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	PPH21	P23594	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	STE50	P25344	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	MRP20	P32387	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
PUS1	YPL212C	SPT10	P35208	640 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SDS24	P38314	527 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	ANS1	P38832	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SSO2	P39926	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	TAD2	P47058	250 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YGR042W	P53227	271 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	FHN1	P53279	174 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	MTM1	P53320	366 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	NRK1	P53915	240 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	GAS2	Q06135	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	ANT1	Q06497	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YOS9	Q99220	542 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	STT4	P37297	1900 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	PHO2	P07269	559 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	PRB1	P09232	635 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	BET2	P20133	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	HXT2	P23585	541 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	CNB1	P25296	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	PBN1	P25580	416 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	DCG1	P32460	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SUA5	P32579	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	PTR2	P32901	601 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
PUS1	YPL212C	ELO1	P39540	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	LRO1	P40345	661 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	TPC1	P53257	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YNR061C	P53747	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	PUT1	P09368	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	PUG1	P40100	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SRB7	P47822	140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	CAF40	P53829	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	PEX25	Q02969	394 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	GIC2	Q06648	383 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	RRI1	Q12468	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	ODC2	Q99297	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	CHO1	P08456	276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	GPI12	P23797	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	LDS1	P31379	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	DBF20	P32328	564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	RML2	P32611	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	TRS65	P32893	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	MSN4	P33749	630 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	ALG3	P38179	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	LAG1	P38703	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	VPS52	P39904	641 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	AVT7	P40501	490 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	CIN2	P46670	268 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SNN1	P48232	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	FMP48	P53233	369 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
PUS1	YPL212C	MRX8	Q05473	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	COQ10	Q08058	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	NPC2	Q12408	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	EAF3	Q12432	401 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	URA6	P15700	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	ZRC1	P20107	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	RNQ1	P25367	405 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	ADH7	P25377	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	HOG1	P32485	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SRY1	P36007	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	RPP1	P38786	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	IDP2	P41939	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	PHO23	P50947	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YGR012W	P53206	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	INN1	P53901	409 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YLR152C	P54072	576 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	NCE101	Q02820	53 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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