RNA–Protein interactions for RNA: YNL006W

LST8, Transcript of Protein required for the transport of Gap1p, yeast

Gene LST8, Length 912 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LST8	YNL006W	MIM1	Q08176	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	RNH203	Q12338	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	STE18	P18852	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	ITR1	P30605	584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	OAC1	P32332	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	SDS22	P36047	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	MAL32	P38158	584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	ILM1	P47155	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	MAL12	P53341	584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	MRPL19	P53875	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	INN1	P53901	409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YMD8	Q03697	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	BNA7	Q04066	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YKL187C	P34231	750 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YBR285W	P38354	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	MDE1	P47095	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	PET191	Q02772	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	RCE1	Q03530	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	RCF1	Q03713	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	IPK1	Q06667	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	SIA1	Q12212	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	NDC1	P32500	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YBR220C	P38318	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	ECM1	P39715	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	POP1	P41812	875 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	SIP18	P50263	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	SAY1	P53324	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	COG5	P53951	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	MCT1	Q12283	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	TAF3	Q12297	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	SCM3	Q12334	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	SPO7	P18410	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	ERG4	P25340	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	STE50	P25344	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	PUP2	P32379	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	MLH1	P38920	769 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	MSS4	P38994	779 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	PHO90	P39535	881 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	IDS2	P46958	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	SFH5	P47008	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	VOA1	P53262	265 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	HLR1	Q04429	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	GSH2	Q08220	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	MCH4	Q08268	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	FIT3	Q08907	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	IZH2	Q12442	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	PDE2	P06776	526 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	PRB1	P09232	635 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	PHO80	P20052	293 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	BOS1	P25385	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	RPC34	P32910	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	SPT10	P35208	640 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	BUR6	P40096	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	ATF1	P40353	525 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	PAM16	P42949	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	MTM1	P53320	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	BUD17	P53727	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	TIM10	P87108	93 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	ACS1	Q01574	713 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	SKO1	Q02100	647 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	GAT3	Q07928	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LST8	YNL006W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LST8	YNL006W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.9 ms