RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	MDM34	P53083	459 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	RCF1	Q03713	159 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	GEP5	Q12393	293 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	SUA5	P32579	426 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	YKL063C	P35725	167 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	RPC37	P36121	282 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	HMT1	P38074	348 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	NIF3	P53081	288 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	COG7	P53195	279 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	VPS60	Q03390	229 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	ASR1	Q06834	288 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	POM33	Q12164	279 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	POX1	P13711	748 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	END3	P39013	349 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	ABZ2	Q03266	374 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	COS2	P0CX12	379 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	COS3	P0CX13	379 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	CAJ1	P39101	391 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	SNX4	P47057	423 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	TAD2	P47058	250 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	YJL028W	P47062	111 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	BOL1	Q3E793	110 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	SFC1	P33303	322 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	SDC1	Q03323	175 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	PEX12	Q04370	399 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	CDC7	P06243	507 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	PPH21	P23594	369 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	PEX31	P53203	462 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	EMI1	Q04406	187 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	YIA6	P40556	373 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	TAF9	Q05027	157 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	INM2	Q05533	292 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	YLR297W	Q05899	129 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	PUT1	P09368	476 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	RNP1	P32385	249 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	SCM4	P32564	187 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	MAL32	P38158	584 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	SPT8	P38915	602 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	GLE2	P40066	365 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	SER33	P40510	469 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	COX16	P47081	118 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	IBA57	P47158	497 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	MAL12	P53341	584 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	NUP49	Q02199	472 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	YPL077C	Q02831	240 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	RSM10	Q03201	203 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	SIA1	Q12212	622 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	SAS5	Q99314	248 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	SGA1	P08019	549 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	YOL162W	P0CF19	215 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	YKR045C	P36138	183 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	VPS20	Q04272	221 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	BOP2	Q06150	570 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	MHT1	Q12525	324 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	ATP6	P00854	259 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	UIP5	P36137	443 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	APE4	P38821	490 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	PEP8	P40335	379 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	CDC14	Q00684	551 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	PST1	Q12355	444 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YKL063C	YKL063C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	GPI12	P23797	304 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	YHI9	P38765	294 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	GTO1	P48239	356 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	YDR286C	Q05530	114 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	YHL049C	P38722	271 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	TEM1	P38987	245 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	SSO2	P39926	295 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	AGP3	P43548	558 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	AGX1	P43567	385 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	KEL2	P50090	882 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	AAH1	P53909	347 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	ATC1	Q04005	294 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	DSE2	P38844	325 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	CIS3	P47001	227 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	YPR011C	Q12251	326 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	ECM13	P38195	257 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	YER135C	P40082	130 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	NUP57	P48837	541 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	CUR1	Q06469	252 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	SLD7	Q08457	257 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		0.68	□□□□□ -2.3

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