RNA–Protein interactions for RNA: YHR138C

YHR138C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YHR138C, Length 345 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHR138C	YHR138C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	NIF3	P53081	288 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	SAS5	Q99314	248 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	RNP1	P32385	249 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	DRE2	P36152	348 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	ARN2	P38724	620 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	GDS1	P41913	522 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	CIS3	P47001	227 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	SUA5	P32579	426 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.63	□□□□□ -2.31	not detected
YHR138C	YHR138C	PST1	Q12355	444 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	GEP5	Q12393	293 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	GAL3	P13045	520 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	YKL063C	P35725	167 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	TEM1	P38987	245 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	YOR114W	Q12219	294 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	DCN1	Q12395	269 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	CCA1	P21269	546 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	MAL32	P38158	584 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	MAL12	P53341	584 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	TAF9	Q05027	157 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	APC9	Q12107	265 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	HMT1	P38074	348 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	MDH2	P22133	377 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	YGL010W	P25338	174 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	FET3	P38993	636 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	YIA6	P40556	373 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	PRM10	P42946	383 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	COX16	P47081	118 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	YPL077C	Q02831	240 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	VPS60	Q03390	229 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	SLD7	Q08457	257 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YHR138C	YHR138C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	RPC37	P36121	282 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	SIF2	P38262	535 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	TDA11	P38854	504 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	MDM34	P53083	459 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	AAH1	P53909	347 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	BOP2	Q06150	570 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	ASR1	Q06834	288 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	NFI1	Q12216	726 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	PPH21	P23594	369 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	PEX4	P29340	183 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	BMT5	P40493	336 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	YJL028W	P47062	111 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	ERG25	P53045	309 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	YBR219C	P38317	127 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	SWC5	P38326	303 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	END3	P39013	349 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	GLE2	P40066	365 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	AGX1	P43567	385 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	SIA1	Q12212	622 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	ERP4	Q12450	207 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.55	□□□□□ -2.32	not detected
YHR138C	YHR138C	YBR220C	P38318	560 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	OST2	P46964	130 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	GTO1	P48239	356 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	ASI3	P53983	676 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	POM33	Q12164	279 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	ATO3	Q12359	275 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	SWI3	P32591	825 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	CYT2	Q00873	224 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	RCF1	Q03713	159 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	AIM20	P40451	204 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	SDC1	Q03323	175 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	MRPS8	Q03799	155 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YHR138C	YHR138C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YHR138C	YHR138C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YHR138C	YHR138C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YHR138C	YHR138C	POX1	P13711	748 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YHR138C	YHR138C	CWP1	P28319	239 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YHR138C	YHR138C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YHR138C	YHR138C	YNR062C	P53748	327 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YHR138C	YHR138C	GPN3	Q06543	272 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YHR138C	YHR138C	CSI2	Q08054	341 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YHR138C	YHR138C	PSY3	Q12318	242 aa		0.52	□□□□□ -2.33

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48 ms