RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W STP2P38704 541 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W TIM17P39515 158 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W PFS2P42841 465 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W BNA6P43619 295 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YJR030CP47101 745 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W UBC12P52491 188 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W MDM34P53083 459 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W JAC1P53193 184 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W POP6P53218 158 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W IZH1Q03419 316 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YDR249CQ03787 373 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W MSS11Q03825 758 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YMR130WQ04223 302 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W COQ11Q05892 277 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YPR114WQ06107 315 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W BSC1Q12140 328 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YLR046CQ12253 270 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W APC2Q12440 853 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YGL194C-AQ2V2P6 80 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa4.96□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W ATP10P18496 279 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W PHO80P20052 293 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W TRX3P25372 127 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W SSO1P32867 290 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W SGE1P33335 543 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W PHD1P36093 366 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W CBP4P37267 147 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W SHE1P38200 338 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YHR177WP38867 453 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W RCY1P39531 840 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W POP1P41812 875 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W PSA1P41940 361 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YJR149WP47177 404 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YGR067CP53243 804 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W PIR1Q03178 341 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W RSF1Q05043 376 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W RNH202Q05635 350 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W DIC1Q06143 298 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W MRPL35Q06678 367 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W ATX2Q12067 313 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YOL107WQ12239 342 aa4.95□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W COX3P00420 269 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W RIP1P08067 215 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W CNB1P25296 175 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W RPS2P25443 254 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W GEX1P25596 615 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W SPS19P32573 292 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W REC114P32841 428 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W SUR1P33300 382 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W TMA19P35691 167 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W ECM31P38122 312 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W INM1P38710 295 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W GEP4P38812 185 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YER184CP39961 794 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W RTS2P40962 232 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W PAC10P48363 199 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W MPS2P53159 387 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W FMP48P53233 369 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W CAF40P53829 373 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W HXT11P54862 567 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W PRM15Q03262 622 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W AEP3Q12089 606 aa4.94□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W IPP1P00817 287 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W CAR2P07991 424 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W SPO7P18410 259 aa4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W SNF6P18888 332 aa4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W CKS1P20486 150 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W PRE7P23724 241 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W RNA14P25298 677 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W ACB1P31787 87 aa4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W MKK1P32490 508 aa4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W CBT1P36038 271 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W RTT105P40063 208 aa4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W XBP1P40489 647 aa4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W PAM16P42949 149 aa4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W COS1P53822 381 aa4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W EOS1P53938 366 aa4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W ELP6Q04868 273 aa4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W DXO1Q06349 442 aa4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YPR022CQ12139 1133 aa4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YLR099W-AQ3E798 87 aa4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YOR338WQ99326 363 aa4.93□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W MES1P00958 751 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YER190C-BP0CX94 160 aa4.92□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YEL077W-AP0CX95 160 aa4.92□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YGR296C-BP0CX96 160 aa4.92□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YPL283W-BP0CX97 160 aa4.92□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W YPR204C-AP0CX98 160 aa4.92□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W ERD2P18414 219 aa4.92□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W ARF2P19146 181 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
VHS1YDR247W UTR1P21373 530 aa4.92□□□□□ -1.62
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