RNA–Protein interactions for RNA: YHR120W

MSH1, Transcript of DNA-binding protein of the mitochondria, yeast

Gene MSH1, Length 2,880 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSH1	YHR120W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	ERD1	P16151	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	POP1	P41812	875 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	PGU1	P47180	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	PMT5	P52867	743 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	CUZ1	P53899	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	RAS1	P01119	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	HIS3	P06633	220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	VPS17	P32913	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	THI2	P38141	450 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	GPI16	P38875	610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	IDS2	P46958	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	GPG1	P53130	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	PRM15	Q03262	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	GIS1	Q03833	894 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	ATP14	Q12349	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	ECM34	P38728	170 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	NSG1	P38837	291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	SWM2	P40342	146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	FMC1	P40491	155 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	PMT6	P42934	759 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	TOS2	P50078	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	MIX14	Q04341	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	AEP3	Q12089	606 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	PHO2	P07269	559 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	UTR1	P21373	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YCK1	P23291	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	PRP28	P23394	588 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	FLO10	P36170	1169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	ECL1	P48235	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YGL235W	P53071	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YNL092W	P53934	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	PAU2	P32612	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	DTR1	P38125	572 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	PAU24	P38155	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	HIS6	P40545	261 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	RPN14	P53196	417 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	VOA1	P53262	265 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	BSC5	P53755	489 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	HLR1	Q04429	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	FEX1	Q08913	375 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	NPC2	Q12408	173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	CDC23	P16522	626 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	ATS1	P31386	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	LEM3	P42838	414 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YFR054C	P43622	192 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	MDE1	P47095	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	PGA1	P53896	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	CRT10	Q08226	957 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	SPC3	Q12133	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	RNP1	P32385	249 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	FET3	P38993	636 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	YNL195C	P40168	261 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	RDR1	Q08904	546 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	FEX2	Q08991	375 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	PUT1	P09368	476 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	FUN26	P31381	517 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	PPG1	P32838	368 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	SDS22	P36047	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	RTC2	P38279	296 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	CHS7	P38843	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	AIM46	P38885	310 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	YJL193W	P39542	402 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	YIL169C	P40442	995 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	SCS7	Q03529	384 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	FLO9	P39712	1322 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSH1	YHR120W	HAP4	P14064	554 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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