RNA–Protein interactions for RNA: YER180C-A

SLO1, Transcript of Protein interacting with Arl3p, yeast

Gene SLO1, Length 258 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLO1	YER180C-A	BNA7	Q04066	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YDR387C	Q04162	555 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YLR040C	Q07988	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	IZH2	Q12442	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	RIB3	Q99258	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	STE50	P25344	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	PTP2	P29461	750 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	VPH2	P32341	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	RPC82	P32349	654 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YAR028W	P39548	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	PIG2	P40187	538 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YIL012W	P40551	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	MTM1	P53320	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	MNT4	P53745	580 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	CRZ1	P53968	678 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	FIT3	Q08907	204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	SRL2	Q12020	392 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YLR126C	Q12288	251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	MSW1	P04803	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	SNF4	P12904	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	SED4	P25365	1065 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	DAL80	P26343	269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	UBC8	P28263	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YME2	P32843	850 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	CLB6	P32943	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	SPC29	P33419	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	DTR1	P38125	572 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	CHL4	P38907	458 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	SLZ1	P40167	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	SSY5	P47002	699 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	HMS2	P47175	358 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	SBH2	P52871	88 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YGR016W	P53209	190 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	TNA1	P53322	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	RRN9	P53437	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	SKO1	Q02100	647 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	ELP6	Q04868	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	MLC2	Q06580	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	IPK1	Q06667	281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	RSC58	Q07979	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	MCH4	Q08268	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	GEP5	Q12393	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	SCEI	P03882	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	OPI3	P05375	206 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	PHO80	P20052	293 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	ERG4	P25340	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YKL107W	P34251	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	RTC2	P38279	296 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YHL044W	P38727	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	SBE22	P38814	852 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	BUR6	P40096	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	HIS6	P40545	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YIP5	P53108	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YDR391C	Q04170	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YDL114W	Q07530	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	ACF2	Q12168	779 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	RNH203	Q12338	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	RRI1	Q12468	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLO1	YER180C-A	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	ECM14	P38836	430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RRG9	P40156	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YIL029C	P40538	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	IRC24	P40580	263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	FMP33	P46998	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	UBC13	P52490	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	COS10	P52924	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	COG5	P53951	403 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	SED1	Q01589	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	OST6	Q03723	332 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	DAL4	Q04895	635 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	MCT1	Q12283	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RTN2	Q12443	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YAK1	P14680	807 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YCL002C	P25565	263 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	MNS1	P32906	549 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	CLG1	P35190	452 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	SPT10	P35208	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	APL3	P38065	1025 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YBR063C	P38083	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 90.6 ms