RNA–Protein interactions for RNA: YDR243C

PRP28, Transcript of RNA helicase in the DEAD-box family, yeast

Gene PRP28, Length 1,767 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP28	YDR243C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	CYT2	Q00873	224 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	ROD1	Q02805	837 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	ENT4	Q07872	247 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	TEN1	Q07921	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
PRP28	YDR243C	TGL5	Q12043	749 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	ERP3	Q12403	225 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	SKS1	Q12505	502 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	TMA17	Q12513	150 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	CYC7	P00045	113 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	SUC2	P00724	532 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	PPH21	P23594	369 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	PEX34	P25584	144 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	ATG15	P25641	520 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	CLB6	P32943	380 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	SNC2	P33328	115 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	OMA1	P36163	345 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	QDR3	P38227	689 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	PHO89	P38361	574 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	CHL4	P38907	458 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	NPP2	P39997	493 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	PUG1	P40100	303 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YJL163C	P46996	555 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	HXT16	P47185	567 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	MKC7	P53379	596 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	BOR1	P53838	576 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	MRPL19	P53875	158 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	SPP2	Q02521	185 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	GIS1	Q03833	894 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	UPS3	Q04006	179 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	CRF1	Q04930	467 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	IPK1	Q06667	281 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	AIM39	Q08223	395 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	EAF3	Q12432	401 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	FLO11	P08640	1367 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	PHO2	P07269	559 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	ERD1	P16151	362 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	UGX2	P32772	223 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	PRY2	P36110	329 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	PET10	P36139	283 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	BNA4	P38169	460 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YBR096W	P38256	230 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	WSC4	P38739	605 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YJL068C	P40363	299 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	LCB2	P40970	561 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	SYS1	P41544	203 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	IME4	P41833	600 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	PTR3	P43606	678 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	DIA3	P52290	468 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	GPI15	P53961	229 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	TGL2	P54857	326 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	TRM12	Q04235	462 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	ANT1	Q06497	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	MRPL35	Q06678	367 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	COQ10	Q08058	207 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	PPM2	Q08282	695 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	RKI1	Q12189	258 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	PST1	Q12355	444 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	DAL82	P21705	255 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YCR061W	P25639	631 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	SRB5	P32585	307 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	MTH1	P35198	433 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	KKQ8	P36004	724 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
PRP28	YDR243C	PHD1	P36093	366 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	AGP2	P38090	596 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	POP8	P38208	133 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	MGE1	P38523	228 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	MUP3	P38734	546 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YIL152W	P40455	235 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	SBH2	P52871	88 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YGL114W	P53134	725 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRP28	YDR243C	YAP1802	P53309	568 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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