RNA–Protein interactions for RNA: YNL077W

APJ1, Transcript of Chaperone with a role in SUMO-mediated protein degradation, yeast

Gene APJ1, Length 1,587 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APJ1	YNL077W	PGU1	P47180	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	HOL1	P53389	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	DML1	Q03652	475 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	FIN1	Q03898	291 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SNX41	Q04053	625 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	PLM2	Q04383	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	ELP6	Q04868	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	BUR2	Q05949	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	IRA1	P18963	3092 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	ERG8	P24521	451 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SLC1	P33333	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	GPX1	P36014	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	TPO5	P36029	618 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	ARN2	P38724	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RPP1	P38786	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	APE4	P38821	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	IPT1	P38954	527 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	PHB1	P40961	287 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RET2	P43621	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YGL101W	P53144	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	ATG4	P53867	494 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SUR7	P54003	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	MIX14	Q04341	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SNO4	Q04902	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	HNT3	Q08702	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RDR1	Q08904	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	HSP32	Q08992	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	BTS1	Q12051	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SIA1	Q12212	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	HER1	Q12276	1246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YRM1	Q12340	786 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	BBP1	Q12365	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SWM1	Q12379	170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	MED11	Q99278	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	NUP1	P20676	1076 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	EHD3	P28817	500 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	TRS65	P32893	560 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YKL071W	P36086	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	GOS1	P38736	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	CHL4	P38907	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YER010C	P40011	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	FCY21	P40039	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	AVT6	P40074	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	IRC7	P43623	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	MDE1	P47095	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	OST6	Q03723	332 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	COX20	Q04935	205 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	COA4	Q05809	96 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	COQ10	Q08058	207 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	NTG2	Q08214	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	TMS1	Q12116	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RLM1	Q12224	676 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	TRM10	Q12400	293 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	LAS17	Q12446	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	CDC9	P04819	755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MET17	P06106	444 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	CTA1	P15202	515 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	RPB8	P20436	146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	SCO1	P23833	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	ADH7	P25377	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YEF1	P32622	495 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MSN4	P33749	630 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	NIC96	P34077	839 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	RCN1	P36054	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	FET3	P38993	636 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	KRE29	P40026	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	REE1	P40893	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YGL260W	P53056	76 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	PGA1	P53896	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	SET6	Q12529	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APJ1	YNL077W	MTR10	Q99189	972 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.9 ms