RNA–Protein interactions for RNA: YGR008C

STF2, Transcript of Protein involved in resistance to desiccation stress, yeastyeast

Gene STF2, Length 255 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
STF2YGR008C MRP20P32387 263 aa0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C ALK2P32789 676 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C RRP1P35178 278 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C OAF3P36023 863 aa0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C EFM2P38347 419 aa0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C ARN1P38731 627 aa0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C VPS55P47111 140 aa0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C APT1P49435 187 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C TAF4P50105 388 aa0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C NSA1P53136 463 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C PEX8P53248 589 aa0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C YHP1Q04116 353 aa0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C NKP2Q06162 153 aa0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C ARR3Q06598 404 aa0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C YDL009CQ12210 107 aa0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C CMC4Q3E7A9 73 aa0.79□□□□□ -2.28
STF2YGR008C RPL39P04650 51 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C ARG81P05085 880 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C PDE2P06776 526 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C TY2A-LR1P0C2J4 438 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C TY2A-FP0CX61 438 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C TY2A-GR2P0CX62 438 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C GCD2P12754 651 aaPredicted RBP0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C CDC23P16522 626 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C ANB1P19211 157 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C TRX3P25372 127 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C SLC1P33333 303 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C NIC96P34077 839 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C YKL100CP34248 587 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C ADE17P38009 592 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C ECM31P38122 312 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C MRP21P38175 177 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C YBL029WP38201 376 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C COG3P40094 801 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C MET18P40469 1032 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C BMT5P40493 336 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C YGR210CP42942 411 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C NIT2P47016 307 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C MAD3P47074 515 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C MAL13P53338 473 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C SPP2Q02521 185 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C TY2A-DR2Q03483 438 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C YDR391CQ04170 232 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C COX20Q04935 205 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C YLR287CQ05881 355 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C RAD34Q06665 692 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C PSK2Q08217 1101 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C RTC5Q12108 567 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C TY2A-BQ12260 438 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C TY2A-OR2Q12293 438 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C YPS3Q12303 508 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C TY2A-OR1Q12439 438 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C IZH2Q12442 317 aa0.78□□□□□ -2.28
STF2YGR008C YAL064W-BO13512 126 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data0.77□□□□□ -2.29not detected
STF2YGR008C RPS17AP02407 136 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C SCEIP03882 235 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C MET17P06106 444 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C RPS17BP14127 136 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C MCK1P21965 375 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C PHO3P24031 467 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C RNA15P25299 296 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C TY2A-CP25383 438 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C YCR099CP25657 155 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C GDH2P33327 1092 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C SIP2P34164 415 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C PRS4P38063 326 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C FAT1P38225 669 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C DIA4P38705 446 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C SFH5P47008 294 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C BAT2P47176 376 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C YNL260CP53846 198 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C COX12Q01519 83 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C MRP51Q02950 344 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C HSP31Q04432 237 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C CDC45Q08032 650 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C SGT1Q08446 395 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C AIM41Q12032 185 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C YLR108CQ12259 485 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C TY2A-DR1Q12392 438 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C YDR010CQ12426 110 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C RMP1Q12530 201 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C YBR298C-AQ8TGK4 73 aa0.77□□□□□ -2.29
STF2YGR008C CDC37P06101 506 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
STF2YGR008C RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
STF2YGR008C RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
STF2YGR008C PHO85P17157 305 aa0.76□□□□□ -2.29
STF2YGR008C RPB5P20434 215 aa0.76□□□□□ -2.29
STF2YGR008C DPB2P24482 689 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
STF2YGR008C TOA1P32773 286 aa0.76□□□□□ -2.29
STF2YGR008C ECM33P38248 429 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
STF2YGR008C RRP4P38792 359 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
STF2YGR008C YER034WP40022 185 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
STF2YGR008C EMP65P40085 556 aa0.76□□□□□ -2.29
STF2YGR008C SYG1P40528 902 aa0.76□□□□□ -2.29
STF2YGR008C RET2P43621 546 aa0.76□□□□□ -2.29
STF2YGR008C YFR054CP43622 192 aa0.76□□□□□ -2.29
STF2YGR008C YDL183CP48569 320 aa0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 109.5 ms