RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	PET122	P10355	254 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	MSC7	P38694	644 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	LEU5	P38702	357 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	TAM41	P53230	385 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	INP53	Q12271	1107 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	QCR2	P07257	368 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	RPB10	P22139	70 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	TAT2	P38967	592 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	POG1	P40473	351 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	YNR062C	P53748	327 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	YCL001W-A	P87012	153 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	MRX8	Q05473	314 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	BNA5	Q05979	453 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	STB3	Q12427	513 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	AI2	P03876	854 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	CPR2	P23285	205 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	YCR101C	P25607	182 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	KKQ8	P36004	724 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	YBR071W	P38243	211 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	AGX1	P43567	385 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	SWF1	Q04629	336 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.59	□□□□□ -1.99	not detected
TOM1	YDR457W	YCL049C	P25577	312 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	SHO1	P40073	367 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	ARO10	Q06408	635 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	YLR012C	Q07927	99 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	YOL073C	Q08232	322 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	BMT6	Q12291	365 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	STF1	P01098	86 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	SIR2	P06700	562 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	PHO3	P24031	467 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	POP5	P28005	173 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	EHD3	P28817	500 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	GET2	P40056	285 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	SLS1	P42900	643 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	TPN1	P53099	579 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	MET14	Q02196	202 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	RFM1	Q12192	310 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	ODC2	Q99297	307 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	BET2	P20133	325 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	OAC1	P32332	324 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SHE1	P38200	338 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YHR112C	P38716	378 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GAT2	P40209	560 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	QRI7	P43122	407 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	NIT3	P49954	291 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SCS3	P53012	380 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	COS12	P53053	380 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	HXT15	P54854	567 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YLR407W	Q06070	228 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TMS1	Q12116	473 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YOR015W	Q12169	119 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SED4	P25365	1065 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YCR061W	P25639	631 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YAT2	P40017	923 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GAL83	Q04739	417 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RIB3	Q99258	208 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YOR1	P53049	1477 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SCEI	P03882	235 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PTP1	P25044	335 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PEX34	P25584	144 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	VNX1	P42839	908 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YDR541C	Q03049	344 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SUE1	Q06524	206 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	HNT3	Q08702	217 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MHT1	Q12525	324 aa		2.59	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RSF2	P46974	1380 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	NUP170	P38181	1502 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TIR1	P10863	254 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PRE4	P30657	266 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	not detected
TOM1	YDR457W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	UBC7	Q02159	165 aa		2.58	□□□□□ -2

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