RNA–Protein interactions for RNA: YBR103W

SIF2, Transcript of WD40 repeat-containing subunit of Set3C histone deacetylase complex, yeast

Gene SIF2, Length 1,608 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIF2	YBR103W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RRN9	P53437	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	OST6	Q03723	332 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	HSP31	Q04432	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ATG10	Q07879	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	UPC2	Q12151	913 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	AGC1	Q12482	902 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RMD5	Q12508	421 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	AI1	P03875	834 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CPR4	P25334	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CDC20	P26309	610 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	BEM1	P29366	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ERG9	P29704	444 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MTH1	P35198	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MRP21	P38175	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	LDB7	P38210	180 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	DBP8	P38719	431 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	UBA4	P38820	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	TIM17	P39515	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RFC2	P40348	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	IME4	P41833	600 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	NSE4	P43124	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MRH4	P53166	561 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SWS2	P53937	143 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MTQ1	P53944	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MRP51	Q02950	344 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MSC1	Q03104	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	TRS31	Q03337	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CAC2	Q04199	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	GIM5	Q04493	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PEX27	Q08580	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SCP1	Q08873	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	GPB1	Q08886	897 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PNS1	Q12412	539 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	DST1	P07273	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	EPT1	P22140	391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	AHC2	P25649	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
SIF2	YBR103W	URA10	P30402	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	TCA17	P32613	152 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	MRPL4	P36517	319 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	RIM2	P38127	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	RRN10	P38204	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	ECM8	P38246	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	MBA1	P38300	278 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	PEP8	P40335	379 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	ICE2	P40499	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	MRX5	P47007	382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	NBP35	P52920	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	SNO2	P53823	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	YNL033W	P53964	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	YNL019C	P53975	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	SAE3	P89114	91 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	CCE1	Q03702	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	RAD34	Q06665	692 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	CYK3	Q07533	885 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	RFU1	Q08003	200 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	CSM4	Q08955	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	VPS68	Q12016	184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	NMD4	Q12129	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	YOP1	Q12402	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	RIB3	Q99258	208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	HFA1	P32874	2273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
SIF2	YBR103W	SEC12	P11655	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	PDX1	P16451	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SIF2	YBR103W	YCL068C	P25593	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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