RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W YHR182WP38870 785 aa-0.39□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W UTP9P38882 575 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W SYS1P41544 203 aa-0.39□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W YOL075CQ08234 1294 aa-0.39□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W YRF1-4O13559 1382 aa-0.4□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W ERV1P27882 189 aa-0.4□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W CDC13P32797 924 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W VAM7P32912 316 aa-0.4□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W SUR1P33300 382 aa-0.4□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W FAD1P38913 306 aa-0.4□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W YNL320WP42840 284 aa-0.4□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W YGL114WP53134 725 aa-0.4□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W SPH1Q06160 661 aa-0.4□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W CSI2Q08054 341 aa-0.4□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W AAD15Q08361 143 aa-0.4□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W RRI2Q12348 645 aa-0.4□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W PGA3Q12746 312 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RDS3YPR094W URA7P28274 579 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W MRPS5P33759 307 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YBR219CP38317 127 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W SRP72P38688 640 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YHL026CP38740 315 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W TCD1P38756 429 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W ATG7P38862 630 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W IRC6P43615 237 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YJL118WP47022 219 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YJL016WP47072 561 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W OST3P48439 350 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W LST7P53237 242 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W RSM27P53305 110 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W MDM1Q01846 1127 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W VPS72Q03388 795 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W STE23Q06010 1027 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W DCN1Q12395 269 aa-0.41□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W CPA1P07258 411 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W GAL7P08431 366 aa-0.42□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W REC107P21651 314 aa-0.42□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W SFC1P33303 322 aa-0.42□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W NOC2P39744 710 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W TPN1P53099 579 aa-0.42□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YNR066CP53752 436 aa-0.42□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W AAH1P53909 347 aa-0.42□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W CAB5Q03941 241 aa-0.42□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W SCM3Q12334 223 aa-0.42□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W CYR1P08678 2026 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W RAD7P06779 565 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W SPS100P13130 326 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W NSP1P14907 823 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W GFD2P25370 566 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W VPH2P32341 215 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W IMP2'P32351 346 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W BUD2P33314 1104 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W KTI12P34253 313 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W AIM29P36154 155 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W MBA1P38300 278 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W SPL2P38839 148 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W PET8P38921 284 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W NDE1P40215 560 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W LYS12P40495 371 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W FYV8P46949 817 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W CIK1Q01649 594 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W MEH1Q02205 184 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YDR541CQ03049 344 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W SMP3Q04174 516 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W CSM3Q04659 317 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W APC5Q08683 685 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W ATG5Q12380 294 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W PAN1P32521 1480 aa-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W PUT1P09368 476 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W RED1P14291 827 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W CPR2P23285 205 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W TOM40P23644 387 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YCR025CP25352 136 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W CAT2P32796 670 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W UPS2P35200 230 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W SUR2P38992 349 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YIL012WP40551 113 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W GPD2P41911 440 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W GON7P46984 123 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W MRPL19P53875 158 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W DAD3P69850 94 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W TVP15Q03860 143 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W TAF11Q04226 346 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W NNT1Q05874 261 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W NDL1Q06568 189 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YPR078CQ06813 372 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W UAF30Q08747 228 aa-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W RIO1Q12196 484 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W RPN5Q12250 445 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W REP1P03871 373 aa-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W PDE2P06776 526 aa-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W DSF1P0CX08 502 aa-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YNR073CP0CX09 502 aa-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W POX1P13711 748 aa-0.45□□□□□ -2.48
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