RNA–Protein interactions for RNA: YOR075W

UFE1, Transcript of t-SNARE protein required for retrograde vesicular traffic, yeast

Gene UFE1, Length 1,041 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UFE1	YOR075W	RFM1	Q12192	310 aa		2.76	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	CUP2	P15315	225 aa		2.75	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	CPT1	P17898	393 aa		2.75	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	OPI1	P21957	404 aa		2.75	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	IME2	P32581	645 aa		2.75	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	YIL059C	P40520	121 aa		2.75	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	INA22	P40576	216 aa		2.75	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	FMP48	P53233	369 aa		2.75	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	YGR168C	P53293	376 aa		2.75	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	TRM10	Q12400	293 aa		2.75	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	SRB2	P34162	210 aa		2.74	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	SLM1	P40485	686 aa		2.74	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	UBX2	Q04228	584 aa		2.74	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	MIM1	Q08176	113 aa		2.74	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	RPB9	P27999	122 aa		2.73	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	DSE1	P40077	573 aa		2.73	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	YFL040W	P43562	540 aa		2.73	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	MGR3	Q04472	501 aa		2.73	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	STE23	Q06010	1027 aa		2.73	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	SPO73	P40031	143 aa		2.72	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	YGL118C	P53132	145 aa		2.72	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	CAX4	P53223	239 aa		2.72	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	IRC4	Q03036	179 aa		2.72	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	TFC7	Q12415	435 aa		2.72	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
UFE1	YOR075W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	INO2	P26798	304 aa		2.71	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	YPS1	P32329	569 aa		2.71	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	YHR035W	P38769	630 aa		2.71	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	ASG7	P46993	209 aa		2.71	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	RPN14	P53196	417 aa		2.71	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	VIK1	Q12045	647 aa		2.71	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	ERD1	P16151	362 aa		2.7	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	PET18	P25362	215 aa		2.7	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	PET8	P38921	284 aa		2.7	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	SSO2	P39926	295 aa		2.7	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	AIM20	P40451	204 aa		2.7	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	YNR066C	P53752	436 aa		2.7	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	YKL162C	P36052	402 aa		2.69	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	OKP1	P53298	406 aa		2.69	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	YPL080C	Q02826	108 aa		2.69	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	CAB5	Q03941	241 aa		2.69	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	VPS20	Q04272	221 aa		2.69	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	CSI1	Q04368	295 aa		2.69	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	YLR297W	Q05899	129 aa		2.69	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	ZRT1	P32804	376 aa		2.68	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	SUR1	P33300	382 aa		2.68	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	CSE1	P33307	960 aa		2.68	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	SWC5	P38326	303 aa		2.68	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	SNX41	Q04053	625 aa		2.68	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	YPL264C	Q08980	353 aa		2.68	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	ERP3	Q12403	225 aa		2.68	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	VPH2	P32341	215 aa		2.67	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	END3	P39013	349 aa		2.67	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	DIA1	P54005	336 aa		2.67	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	LAG2	Q92325	660 aa		2.67	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.66	□□□□□ -1.98	not detected
UFE1	YOR075W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	RPS23B	P0CX30	145 aa		2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	MCH2	P36032	473 aa		2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	AIM29	P36154	155 aa		2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	MED8	P38304	223 aa		2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	ECM14	P38836	430 aa		2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	PES4	P39684	611 aa		2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	YJL144W	P47009	104 aa		2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	IGO1	P53897	168 aa		2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	YDR222W	Q04925	415 aa		2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	YPR1	Q12458	312 aa		2.66	□□□□□ -1.98
UFE1	YOR075W	YPR096C	O13587	100 aa		2.65	□□□□□ -1.99
UFE1	YOR075W	DAL5	P15365	543 aa		2.65	□□□□□ -1.99
UFE1	YOR075W	IFM1	P25038	676 aa		2.65	□□□□□ -1.99
UFE1	YOR075W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
UFE1	YOR075W	YDR089W	P38966	869 aa		2.65	□□□□□ -1.99
UFE1	YOR075W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
UFE1	YOR075W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
UFE1	YOR075W	YOR292C	Q08743	309 aa		2.65	□□□□□ -1.99
UFE1	YOR075W	YPR063C	Q12160	140 aa		2.65	□□□□□ -1.99
UFE1	YOR075W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
UFE1	YOR075W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.7 ms