RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	IZH4	Q99393	312 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YCR006C	P25350	157 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	POF1	P25576	258 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	MET30	P39014	640 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	PHO90	P39535	881 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YIL060W	P40519	144 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YCH1	P42937	148 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YFL015C	P43578	164 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	KEG1	P43614	200 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YJR012C	P47087	207 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	USE1	P53146	245 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	IBD2	P53892	351 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	RIF2	Q06208	395 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	MCH4	Q08268	501 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YDL177C	Q12257	170 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	HEM15	P16622	393 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	UTR4	P32626	227 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	RIM2	P38127	377 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YBR241C	P38142	488 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	CYC2	P38909	366 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	SNX4	P47057	423 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	MMS2	P53152	137 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	MST27	P53176	234 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	ALG13	P53178	202 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	GPI1	P53306	609 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	MTM1	P53320	366 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	ASI1	P54074	624 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	RHO4	Q00246	291 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YNG1	Q08465	219 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	SRL2	Q12020	392 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	ORT1	Q12375	292 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	SPO12	P17123	173 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	BUB3	P26449	341 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.04	□□□□□ -1.92	not detected
TOP1	YOL006C	TDA10	P42938	290 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	PRY1	P47032	299 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	GTR2	P53290	341 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YNR066C	P53752	436 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	ASI3	P53983	676 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YOL019W	Q08157	551 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	SGT1	Q08446	395 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	NSL1	Q12143	216 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YCT1	Q12235	531 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	CPT1	P17898	393 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	QRI5	P32344	111 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	BDH2	P39713	417 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	COG3	P40094	801 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	SIM1	P40472	476 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	GDS1	P41913	522 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YJR030C	P47101	745 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	NUP57	P48837	541 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YIP1	P53039	248 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	MAL13	P53338	473 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	SPR6	Q01684	191 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	NUP49	Q02199	472 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	HEM25	Q07534	307 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YPD1	Q07688	167 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	SWI1	P09547	1314 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	LSB5	P25369	354 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	COQ2	P32378	372 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	CLG1	P35190	452 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	FLO10	P36170	1169 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YCR087C-A	P37263	153 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	ECM13	P38195	257 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YJR054W	P47114	497 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	BUL1	P48524	976 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	CDH1	P53197	566 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	CPR8	P53728	308 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	NRK1	P53915	240 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	TRM82	Q03774	444 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	ECI1	Q05871	280 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	GAT3	Q07928	141 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	NCA2	Q12374	616 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	ICT1	Q12385	394 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	SIR4	P11978	1358 aa		3.03	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	PET54	P10834	293 aa		3.02	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 67 ms