RNA–Protein interactions for RNA: YNL293W

MSB3, Transcript of Rab GTPase-activating protein, yeast

Gene MSB3, Length 1,902 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSB3	YNL293W	MSC2	Q03455	724 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	ROY1	Q04847	553 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	RNH202	Q05635	350 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	ATG5	Q12380	294 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	SRD1	P09007	221 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	PEX34	P25584	144 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	YCR102C	P25608	368 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	ARE1	P25628	610 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	ATG15	P25641	520 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	MET22	P32179	357 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	COT1	P32798	439 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	NAS2	P40555	220 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	BAP3	P41815	604 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	AVT4	P50944	713 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	SKP1	P52286	194 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	SKG3	Q06315	1026 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	EAF3	Q12432	401 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	TMA17	Q12513	150 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	SRF1	Q12516	437 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	FLO11	P08640	1367 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	SUC2	P00724	532 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	RHO2	P06781	192 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	MSF1	P08425	469 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	CDC34	P14682	295 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	PUP1	P25043	261 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	ELO2	P25358	347 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	STP22	P25604	385 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	TRK2	P28584	889 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	MRPL6	P32904	214 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	SNC2	P33328	115 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	DBP8	P38719	431 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	PNT1	P38969	423 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	HPA3	P39979	161 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	GET2	P40056	285 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	SET4	P42948	560 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	PFD1	P46988	109 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	CYT2	Q00873	224 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	TMN2	Q04562	672 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	RRI1	Q12468	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	ERD1	P16151	362 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	STE14	P32584	239 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	MDL1	P33310	695 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	SFB3	P38810	929 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	NIT1	P40447	199 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	PTR3	P43606	678 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	MKC7	P53379	596 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	RGT2	Q12300	763 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	QCR2	P07257	368 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	GAL7	P08431	366 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	PPH21	P23594	369 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	RML2	P32611	393 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	MGE1	P38523	228 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	YAR028W	P39548	234 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	VAC8	P39968	578 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	NPP2	P39997	493 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	YER188W	P40103	239 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	LCB2	P40970	561 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	SMK1	P41808	388 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	UPS3	Q04006	179 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	YMR130W	Q04223	302 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	GPI11	Q06636	219 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	TEN1	Q07921	160 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	AIM39	Q08223	395 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	YDR018C	Q12185	396 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	ERP3	Q12403	225 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	SKS1	Q12505	502 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	EPT1	P22140	391 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	YCR061W	P25639	631 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	YEF1	P32622	495 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	PRY2	P36110	329 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	YBR096W	P38256	230 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	OTU1	P43558	301 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	DIA3	P52290	468 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	AIF1	P52923	378 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MSB3	YNL293W	YGL138C	P53122	345 aa		6.65	□□□□□ -1.34

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.9 ms