RNA–Protein interactions for RNA: YMR053C

STB2, Transcript of Protein that interacts with Sin3p in a two-hybrid assay, yeast

Gene STB2, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB2	YMR053C	MMS2	P53152	137 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	PEX31	P53203	462 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	IBD2	P53892	351 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	ARL3	Q02804	198 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	CSN9	Q03981	162 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	MLH3	Q12083	715 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	GDA1	P32621	518 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	YKR041W	P36134	250 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	RFC5	P38251	354 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	VPS52	P39904	641 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	UBP5	P39944	805 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	SYG1	P40528	902 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	UBP8	P50102	471 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	ALG13	P53178	202 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	POM33	Q12164	279 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	FYV7	Q12247	151 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	ERP3	Q12403	225 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	CUP2	P15315	225 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	FUN26	P31381	517 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	BCS1	P32839	456 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	SGE1	P33335	543 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	YJR030C	P47101	745 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	DPP1	Q05521	289 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	RGT2	Q12300	763 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	IZH4	Q99393	312 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	MDS3	P53094	1487 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	TAF2	P23255	1407 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	TOA2	P32774	122 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	FCY21	P40039	528 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	GUF1	P46943	645 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	IRC18	P47056	224 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	TOS2	P50078	622 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	SNX41	Q04053	625 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	YML096W	Q04489	525 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	ECI1	Q05871	280 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	SSK1	Q07084	712 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	ACB1	P31787	87 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	ECM15	P35195	104 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	TVP38	P36164	337 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	FMP23	P38231	175 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	POP1	P41812	875 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	TPO3	Q06451	622 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	LDB18	Q07887	179 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	ENB1	Q08299	606 aa		4.13	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	FPS1	P23900	669 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	PMT2	P31382	759 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	ATO2	P32907	282 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	SKN1	P33336	771 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	SHP1	P34223	423 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	CUE1	P38428	203 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	YJL016W	P47072	561 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	GTR2	P53290	341 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	YNL092W	P53934	400 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	HSP31	Q04432	237 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	SWF1	Q04629	336 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	IZH3	Q07959	543 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	IMA2	Q08295	589 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	RTR2	Q12378	196 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	SPT3	P06844	337 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	DCC1	P25559	380 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	LAC1	P28496	418 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
STB2	YMR053C	MET30	P39014	640 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	GAT1	P43574	510 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	NUP57	P48837	541 aa		4.12	□□□□□ -1.75
STB2	YMR053C	CWC27	Q02770	301 aa		4.12	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.1 ms