RNA–Protein interactions for RNA: YHR063C

PAN5, Transcript of 2-dehydropantoate 2-reductase, yeastyeast

Gene PAN5, Length 1,140 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAN5YHR063C SGT2Q12118 346 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C MCT1Q12283 360 aa3.36□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C PCL9Q12477 304 aa3.36□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa3.36□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C MEX67Q99257 599 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C YLR422WQ06409 1932 aa3.36□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C VPS13Q07878 3144 aa3.36□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C EBP2P36049 427 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C DAD2P36162 133 aa3.35□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C GPI18P38211 433 aa3.35□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C SEO1P39709 593 aa3.35□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C PSY3Q12318 242 aa3.35□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C SRN2Q99176 213 aa3.35□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C BI3Q9ZZW7 517 aa3.35□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C RPS3P05750 240 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C HAP2P06774 265 aa3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C CDC33P07260 213 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C PHO84P25297 587 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C CHA1P25379 360 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C YEL043WP32618 956 aa3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C YSW1P38280 609 aa3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C TCD1P38756 429 aa3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C DSE1P40077 573 aa3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C SEC27P41811 889 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C IGD1P43598 195 aa3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C YPS5P53057 165 aa3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C YGR018CP53211 109 aa3.34□□□□□ -1.87
PAN5YHR063C ADH1P00330 348 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C DAP2P18962 818 aa3.33□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C GIT1P25346 518 aa3.33□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C DEP1P31385 405 aa3.33□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C HMT1P38074 348 aa3.33□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C SMC2P38989 1170 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YER189WP40104 122 aa3.33□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C CIN2P46670 268 aa3.33□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C MKC7P53379 596 aa3.33□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YNR068CP53754 272 aa3.33□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C REX2P54964 269 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C DBP9Q06218 594 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C GAT3Q07928 141 aa3.33□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C RAD10P06838 210 aa3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C CBP6P07253 162 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C EFB1P32471 206 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C LSM12P38828 187 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C PCL7P40186 285 aa3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C CTK3P46963 296 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YJR054WP47114 497 aa3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C MND1P53102 219 aa3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
PAN5YHR063C PRO2P54885 456 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C VHS1Q03785 461 aa3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C ARO80Q04052 950 aa3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C SML1Q04964 104 aa3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C VAC14Q06708 880 aa3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YFH1Q07540 174 aa3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C PML1Q07930 204 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C DAS2Q12084 232 aa3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C EMP46Q12396 444 aa3.32□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C VPS3P23643 1011 aa3.31□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C TKL2P33315 681 aa3.31□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C RCK2P38623 610 aa3.31□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C FHL1P39521 936 aa3.31□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C HEM14P40012 539 aa3.31□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C TRF5P48561 642 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C SHE4P51534 789 aa3.31□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C KAP114P53067 1004 aa3.31□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C PDR16P53860 351 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C MGR3Q04472 501 aa3.31□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C MSC3Q05812 728 aa3.31□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YBL111CQ3E7Y5 667 aa3.31□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C RPC40P07703 335 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C CKI1P20485 582 aa3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C MRPL8P22353 238 aa3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C SUR1P33300 382 aa3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C SRB2P34162 210 aa3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C HIS2P38635 335 aa3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C WSS1P38838 269 aa3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C AVT2P39981 480 aa3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C SEH1P53011 349 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YGL262WP53054 175 aa3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C CWC22P53333 577 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C TPS1Q00764 495 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C ENT5Q03769 411 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C DDC1Q08949 612 aa3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C GPM2Q12008 311 aa3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YDR061WQ12298 539 aa3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YOR338WQ99326 363 aa3.3□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C JIP3O13555 125 aa3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C YLR462WO13556 202 aa3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C RPL6BP05739 176 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C STE7P06784 515 aa3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C MAS1P10507 462 aa3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C PUT4P15380 627 aa3.29□□□□□ -1.88
PAN5YHR063C CMK2P22517 447 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.3 ms