RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	GAT3	Q07928	141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	NTG2	Q08214	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	FRE8	Q12209	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	FSH3	Q99369	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	ARG81	P05085	880 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	SEC12	P11655	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	MER1	P16523	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	MCM10	P32354	571 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	OAF3	P36023	863 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	YNL195C	P40168	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	UBC13	P52490	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	FIT3	Q08907	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	THI4	P32318	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	CLB6	P32943	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	SLC1	P33333	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	KRE29	P40026	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	YHC3	P47040	408 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	YML119W	Q03208	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RLM1	Q12224	676 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RPN6	Q12377	434 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RPB8	P20436	146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	GIT1	P25346	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	HSP30	P25619	332 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	DAL3	P32459	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	YPT53	P36019	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	MRPL17	P36528	281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	YBR138C	P38277	524 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	ARN1	P38731	627 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	BIG1	P38813	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	NIT3	P49954	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	COS1	P53822	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	YNL046W	P53956	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RSC9	Q03124	581 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	MUM3	Q08750	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	TOP3	P13099	656 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	PHO81	P17442	1178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	ERG4	P25340	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	PHO91	P27514	894 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	YBR032W	P38223	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	LNP1	P38878	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	SHE4	P51534	789 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	TWF1	P53250	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	UIP4	Q08926	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	ERP4	Q12450	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	APA2	P22108	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	SPT10	P35208	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	GPX1	P36014	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RCK1	P38622	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	PEX18	P38855	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	GMC1	Q04399	608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	COQ10	Q08058	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	RTN2	Q12443	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	LAS17	Q12446	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	HNM1	P19807	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	CNA1	P23287	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	SED4	P25365	1065 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	PUP2	P32379	260 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	TIM12	P32830	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	TRS65	P32893	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	MDL1	P33310	695 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	ECM8	P38246	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YJR142W	P47173	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YIP5	P53108	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	PET191	Q02772	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	VPS60	Q03390	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	KRE28	Q04431	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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