RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	BUB3	P26449	341 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	ADE1	P27616	306 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	ATP7	P30902	174 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	SEC17	P32602	292 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	SPO23	P33757	523 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	GAB1	P41733	394 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	MMT1	Q03218	510 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	BNA5	Q05979	453 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	VPS74	Q06385	345 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	ASA1	Q06822	443 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	MUM3	Q08750	479 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YOL107W	Q12239	342 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	RUP1	Q12242	671 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YDR262W	Q12331	272 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	RPN6	Q12377	434 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	SNF8	Q12483	233 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	CSF1	Q12150	2958 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YPR096C	O13587	100 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	GAL7	P08431	366 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	UGA1	P17649	471 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	CWP1	P28319	239 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	TFC1	P32367	649 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	FAD1	P38913	306 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	PRM10	P42946	383 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	SDT1	P53078	280 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	GET1	P53192	235 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	MEP3	P53390	489 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YNL033W	P53964	284 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YNL019C	P53975	284 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	MSC1	Q03104	513 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	SPC2	Q04969	178 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	REX4	Q08237	289 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	GET4	Q12125	312 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	SKM1	Q12469	655 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YPR064W	Q12492	139 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	LAG2	Q92325	660 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	UNG1	P12887	359 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YCR007C	P25354	239 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	SIN4	P32259	974 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	MCM10	P32354	571 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YBL059W	P34224	193 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	BNA4	P38169	460 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	MTW1	P39731	289 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	ELP2	P42935	788 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	PMT4	P46971	762 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	ILM1	P47155	203 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	KEL2	P50090	882 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	GPI1	P53306	609 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	GOR1	P53839	350 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	GMC2	Q06201	188 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YLL007C	Q07799	665 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YOL131W	Q08270	108 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	DAP2	P18962	818 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	NAM9	P27929	486 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	SSO1	P32867	290 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	STP2	P38704	541 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	MTC6	P38849	526 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	MNL1	P38888	796 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	PAC11	P40960	533 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	RAD17	P48581	401 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	ROG1	P53118	685 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	COS6	P53344	381 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	BSC5	P53755	489 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	RRN11	Q04712	507 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	BOP2	Q06150	570 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	PHO92	Q06390	306 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	MMT2	Q08970	484 aa		3.79	□□□□□ -1.8

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