RNA–Protein interactions for RNA: YNR069C

BSC5, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene BSC5, Length 1,470 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BSC5	YNR069C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	FMP16	Q12497	93 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	FAR1	P21268	830 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	GPI12	P23797	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	TPO5	P36029	618 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	YKL162C	P36052	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	MIX23	P38162	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	COX14	P39103	70 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	RBG1	P39729	369 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	YGL242C	P53066	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	YOL107W	Q12239	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	ECM29	P38737	1868 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
BSC5	YNR069C	ECM8	P38246	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	SPL2	P38839	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	NDE2	Q07500	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	SPS22	P25380	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	IST2	P38250	946 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	YBP1	P38315	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	SBE22	P38814	852 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	YIL029C	P40538	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	LOH1	P47055	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	COS1	P53822	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	IBD2	P53892	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	AFT2	Q08957	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	IRA2	P19158	3079 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	AGA1	P32323	725 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	MKK1	P32490	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	CTM1	P38818	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	KEG1	P43614	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	LCB3	P47013	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	NUP84	P52891	726 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	TAF6	P53040	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	MRM2	P53123	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	YNL260C	P53846	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	ATC1	Q04005	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	SRL1	Q08673	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	NTG1	P31378	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	PHA2	P32452	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	TMT1	P32643	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	SPT8	P38915	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	FHL1	P39521	936 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	AIM24	P47127	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	HOP2	P53187	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	MDM36	Q06820	579 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	TIP41	Q12199	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	EAF3	Q12432	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	FMP27	Q06179	2628 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	CDC23	P16522	626 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	PEX32	P38292	413 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	SCC4	P40090	624 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	CSM3	Q04659	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	LDB17	Q12342	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	TRP1	P00912	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	POP5	P28005	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	YJL213W	P40896	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BSC5	YNR069C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	HEM15	P16622	393 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	KDX1	P36005	433 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	DTR1	P38125	572 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	MDM31	P38880	579 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	RCY1	P39531	840 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	YIL067C	P40514	678 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	YCH1	P42937	148 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	YPL080C	Q02826	108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	RRN11	Q04712	507 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	GGA1	Q06336	557 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	RGT2	Q12300	763 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BSC5	YNR069C	CYC3	P06182	269 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 91.9 ms