RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W SNA4Q07549 140 aa7.91□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W COQ10Q08058 207 aa7.91□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W YPT6Q99260 215 aa7.91□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W TPK2P06245 380 aa7.9□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W TOP3P13099 656 aa7.9□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W EXO70P19658 623 aa7.9□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W THI4P32318 326 aa7.9□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W MNS1P32906 549 aa7.9□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W NAS2P40555 220 aa7.9□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W IMA5P40884 581 aa7.9□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W IRC7P43623 340 aa7.9□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W ATG38Q05789 226 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W VPS36Q06696 566 aa7.9□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W CSI2Q08054 341 aa7.9□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W YOL087CQ99247 1116 aa7.9□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W THP2O13539 261 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W UGA1P17649 471 aa7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W SED4P25365 1065 aa7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W POP1P41812 875 aa7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W YGR201CP42936 225 aa7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W TDA10P42938 290 aa7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W CCT7P42943 550 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W DPB11P47027 764 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W NUP57P48837 541 aa7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W NIT3P49954 291 aa7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W MPC1P53157 130 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W IGO1P53897 168 aa7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W CTS2Q06350 511 aa7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W FRE8Q12209 686 aa7.89□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W MSI1P13712 422 aa7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W ERG4P25340 473 aa7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W DEP1P31385 405 aa7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W CLB6P32943 380 aa7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W SPT10P35208 640 aa7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W IST2P38250 946 aa7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data7.88□□□□□ -1.15not detected
YLR349WYLR349W ISC1P40015 477 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W YFL066CP43538 392 aa7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W YNR062CP53748 327 aa7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W YPL077CQ02831 240 aa7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W YMR279CQ03263 540 aa7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W AGE1Q04412 482 aa7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W ARO10Q06408 635 aa7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W MFG1Q07684 458 aa7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W YPR202WQ08993 238 aa7.88□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W RPS23BP0CX30 145 aa7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W YCR100CP25606 316 aa7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W YKL102CP34249 101 aa7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W JEN1P36035 616 aa7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W SHM2P37291 469 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W HPM1P40481 377 aa7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W SNM1P40993 198 aa7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W GLR1P41921 483 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W GCN20P43535 752 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W MEP3P53390 489 aa7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W RIM9Q04734 239 aa7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W SYO1Q07395 620 aa7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W HRT1Q08273 121 aa7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W CAM1P29547 415 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W SNC1P31109 117 aa7.86□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data7.86□□□□□ -1.15not detected
YLR349WYLR349W HBS1P32769 611 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W VMA11P32842 164 aa7.86□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W TRS65P32893 560 aa7.86□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W ARC19P33204 171 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W GPX1P36014 167 aa7.86□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W ABM1P47146 123 aa7.86□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W DIA3P52290 468 aa7.86□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W SHE9Q04172 456 aa7.86□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W PIN3Q06449 215 aa7.86□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W NDL1Q06568 189 aa7.86□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W NSL1Q12143 216 aa7.86□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W FSH3Q99369 266 aa7.86□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W ATP6P00854 259 aa7.85□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W SPO7P18410 259 aa7.85□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W RHB1P25378 209 aa7.85□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W RPS5P26783 225 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W ARP2P32381 391 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W GSH1P32477 678 aa7.85□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W MRE11P32829 692 aa7.85□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W RPP1P38786 293 aa7.85□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W YKR011CQ02209 353 aa7.85□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W MUM3Q08750 479 aa7.85□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W PPA2P28239 310 aa7.84□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W RPN2P32565 945 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W TNA1P53322 534 aa7.84□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W HSP31Q04432 237 aa7.84□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W RNH202Q05635 350 aa7.84□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W DBP9Q06218 594 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W YPQ2Q06328 317 aa7.84□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W SSK1Q07084 712 aa7.84□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W RRT8Q08219 342 aa7.84□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W IZH2Q12442 317 aa7.84□□□□□ -1.15
YLR349WYLR349W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.6 ms