RNA–Protein interactions for RNA: YKL108W

SLD2, Transcript of Single-stranded DNA origin-binding and annealing protein, yeast

Gene SLD2, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLD2	YKL108W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	SRB4	P32569	687 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	ECM8	P38246	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	SIP3	P38717	1229 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	JLP2	P40206	208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	YAR1	P46683	200 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	IRC4	Q03036	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	ATG2	P53855	1592 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	RAD50	P12753	1312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	DAL82	P21705	255 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	ERG9	P29704	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	PMU1	P36069	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	TDA11	P38854	504 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	OTU1	P43558	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	SNT2	P53127	1403 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	CAF40	P53829	373 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	GTO3	Q04806	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	RTT103	Q05543	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	ASR1	Q06834	288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	AYT1	Q12226	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	HEM15	P16622	393 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	PHA2	P32452	334 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	NAT2	P37293	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	COA1	P40452	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	THI7	Q05998	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	PAM18	Q07914	168 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	APC9	Q12107	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	AGA1	P32323	725 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	COX14	P39103	70 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	HIT1	P46973	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	RTT101	P47050	842 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	RAD17	P48581	401 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	HCH1	P53834	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	RIM13	Q03792	727 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	NDE2	Q07500	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	TLG2	Q08144	397 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	POM33	Q12164	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	RGT2	Q12300	763 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	SIR4	P11978	1358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	KRE5	P22023	1365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	MRS3	P10566	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	RRT12	P25381	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	MEI5	P32489	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	KAR9	P32526	644 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	MIX23	P38162	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	LDB7	P38210	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	DFG10	P40526	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	MRM2	P53123	320 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	ALE1	Q08548	619 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	MDS3	P53094	1487 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	VTH1	P40438	1549 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	VTH2	P40890	1549 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	MRPS28	P21771	286 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	YKL063C	P35725	167 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	YHR035W	P38769	630 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	RPR2	P40571	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	MRPL50	P53724	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	OST6	Q03723	332 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	FMP42	Q04991	504 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	MDM36	Q06820	579 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	DDC1	Q08949	612 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLD2	YKL108W	SAL1	D6W196	494 aa		4.53	□□□□□ -1.69
SLD2	YKL108W	ATP6	P00854	259 aa		4.53	□□□□□ -1.69
SLD2	YKL108W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
SLD2	YKL108W	DAL81	P21657	970 aa		4.53	□□□□□ -1.69
SLD2	YKL108W	AVT5	P38176	459 aa		4.53	□□□□□ -1.69
SLD2	YKL108W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69

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