RNA–Protein interactions for RNA: YJL217W

REE1, Transcript of Cytoplasmic protein involved in the regulation of enolase (ENO1), yeast

Gene REE1, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REE1	YJL217W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	BNA6	P43619	295 aa		3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	SSN8	P47821	323 aa		3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	NAS6	P50086	228 aa		3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	BIO3	P50277	480 aa		3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	AVT4	P50944	713 aa		3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	YNL260C	P53846	198 aa		3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	YNL181W	P53878	407 aa		3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	STP1	Q00947	519 aa		3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	YMR321C	Q04898	105 aa		3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	YPR172W	Q06608	200 aa		3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	SRL2	Q12020	392 aa		3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	BTS1	Q12051	335 aa		3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	YDL009C	Q12210	107 aa		3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.52	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	RAD7	P06779	565 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	TOA2	P32774	122 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.51	□□□□□ -1.85	not detected
REE1	YJL217W	SMF2	P38778	549 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	SNO3	P43544	222 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	FMP33	P46998	180 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	GWT1	P47026	490 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	ABM1	P47146	123 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	TIM21	P53220	239 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	RRN9	P53437	365 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	SPC24	Q04477	213 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	SHS1	Q07657	551 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	SMC5	Q08204	1093 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	BSC6	Q08280	497 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	TAF10	Q12030	206 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	YDR018C	Q12185	396 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	CRC1	Q12289	327 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	EMP46	Q12396	444 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	YOP1	Q12402	180 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	GIS3	Q12418	502 aa		3.51	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	MAS2	P11914	482 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	SLY1	P22213	666 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	PRR1	P28708	518 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	RPC37	P36121	282 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	FZO1	P38297	855 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	POP4	P38336	279 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	AZR1	P50080	613 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	POP6	P53218	158 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	YNR048W	P53740	393 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	RIM13	Q03792	727 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	YMR027W	Q04371	470 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	COX20	Q04935	205 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	CTS2	Q06350	511 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	GAT3	Q07928	141 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	TIM18	Q08749	192 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	YPQ1	Q12010	308 aa		3.5	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.49	□□□□□ -1.85	not detected
REE1	YJL217W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	RAD3	P06839	778 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	SUA5	P32579	426 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	MNS1	P32906	549 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	GEP4	P38812	185 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	GUF1	P46943	645 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	LOH1	P47055	219 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	SPP2	Q02521	185 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	PET117	Q02771	107 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	ODC1	Q03028	310 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	CCE1	Q03702	353 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	BOP2	Q06150	570 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	BCP1	Q06338	283 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	VPS74	Q06385	345 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	CDD1	Q06549	142 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	YET3	Q07451	203 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	SGT1	Q08446	395 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	MUM3	Q08750	479 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	SET6	Q12529	373 aa		3.49	□□□□□ -1.85
REE1	YJL217W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85

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