RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W LEM3P42838 414 aa3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W BNA3P47039 444 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W UBX6P47049 396 aa3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W RBL2P48606 106 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W TOS2P50078 622 aa3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W BSC5P53755 489 aa3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W ASI1P54074 624 aa3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W PET191Q02772 108 aa3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W SRP1Q02821 542 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W TLG1Q03322 224 aa3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W DML1Q03652 475 aa3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W ERF2Q06551 359 aa3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YLR040CQ07988 224 aa3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W ACF2Q12168 779 aa3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W PST2Q12335 198 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W TIM9O74700 87 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W IPP1P00817 287 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W CUP1-1P0CX80 61 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W CUP1-2P0CX81 61 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W STE50P25344 346 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W RAD51P25454 400 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W GSH1P32477 678 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YEF1P32622 495 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YHR180WP38868 163 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W CHL4P38907 458 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W AST2P39945 430 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W DDI1P40087 428 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W PDS1P40316 373 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YRB2P40517 327 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W MPH1P40562 993 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W REE1P40893 198 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W STB1P42845 420 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W COS1P53822 381 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W INP1Q03694 420 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YMD8Q03697 442 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W RCF1Q03713 159 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SNX41Q04053 625 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W ARP10Q04549 284 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W ELP6Q04868 273 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YPR109WQ06104 294 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W HER1Q12276 1246 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W NPC2Q12408 173 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W PNS1Q12412 539 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W PCL9Q12477 304 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YGR161W-CQ3E744 92 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W FLO9P39712 1322 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YGL041W-AP0C5N3 154 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SAC7P17121 654 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W NFS1P25374 497 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W THI4P32318 326 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YBR138CP38277 524 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YHR219WP38900 624 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W IRC7P43623 340 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W ALG12P53730 551 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W ATG4P53867 494 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SCS7Q03529 384 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W GRX3Q03835 250 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YLR345WQ06137 509 aa3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W QCR7P00128 127 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W HMG1P12683 1054 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SPO7P18410 259 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YPK2P18961 677 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YCK1P23291 538 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W ECT1P33412 323 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W MTC2P34246 357 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YMR262WP38430 313 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data3.7□□□□□ -1.82not detected
SPC105YGL093W RPP1P38786 293 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SBE22P38814 852 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W EGD2P38879 174 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W XBP1P40489 647 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SWP82P43554 623 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YGR066CP53242 292 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SDC1Q03323 175 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W GAS2Q06135 555 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W FMP45Q07651 309 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YDL177CQ12257 170 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W Q0144Q9ZZW2 109 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SIR3P06701 978 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W STE12P13574 688 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W TIF3P34167 436 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W GPI16P38875 610 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W FET3P38993 636 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YNL195CP40168 261 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W IRC5P43610 853 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SRL4Q03085 281 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W RSM28Q03430 361 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YOR238WQ08634 303 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.3 ms