RNA–Protein interactions for RNA: YBL093C

ROX3, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene ROX3, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROX3	YBL093C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	KRE29	P40026	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	FET5	P43561	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	HOC1	P47124	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	IBA57	P47158	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	TWF1	P53250	332 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	MTQ1	P53944	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	MFB1	Q04922	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	BNA5	Q05979	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	GLE1	Q12315	538 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	TMA17	Q12513	150 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	MED11	Q99278	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	VCX1	Q99385	411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	CBS1	P14066	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	AAC3	P18238	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	MSN2	P33748	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	CDS1	P38221	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YLF2	P38746	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	APE4	P38821	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	IPT1	P38954	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	HMS2	P47175	358 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	KRE28	Q04431	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	FMP42	Q04991	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YLR030W	Q07967	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	FDH1	Q08911	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	CSF1	Q12150	2958 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	TRM10	Q12400	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	TFS1	P14306	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	APN1	P22936	367 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YCK1	P23291	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	CWP1	P28319	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	SOK1	P40317	901 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YIL152W	P40455	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	CFD1	P40558	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	MET28	P40573	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	PMT6	P42934	759 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	NIT2	P47016	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	AAD10	P47182	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	NUP57	P48837	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	GRX5	Q02784	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	HLR1	Q04429	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	NAT4	Q04751	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	STE12	P13574	688 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YCR006C	P25350	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	MXR2	P25566	168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	IMG1	P25626	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SRO77	P38163	1010 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	RPS27B	P38711	82 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ALP1	P38971	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YEL068C	P39977	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	IES5	P40060	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	RRG9	P40156	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	MEP3	P53390	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YSA1	Q01976	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YMD8	Q03697	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SMA2	Q04658	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	RNH1	Q04740	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	DIC1	Q06143	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	FMP45	Q07651	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YEH1	Q07804	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SKM1	Q12469	655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	GAL4	P04386	881 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	MET17	P06106	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	STP22	P25604	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	OAC1	P32332	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YOR062C	P36025	268 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ECM4	P36156	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	TRR2	P38816	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ANS1	P38832	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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