RNA–Protein interactions for RNA: YAL055W

PEX22, Transcript of Putative peroxisomal membrane protein, yeast

Gene PEX22, Length 543 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX22	YAL055W	YBR144C	P34215	104 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	RPS27B	P38711	82 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	KRE9	P39005	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	GCD10	P41814	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	SDT1	P53078	280 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	YGR126W	P53274	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	GTR2	P53290	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	YNL140C	P53910	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	GLO2	Q05584	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	REX4	Q08237	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	NMD4	Q12129	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	RHO2	P06781	192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	MXR2	P25566	168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	ZIP1	P31111	875 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	FRT2	P39734	528 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	VPS52	P39904	641 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	SER3	P40054	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	BIO3	P50277	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	LCL3	P53153	274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	MET31	Q03081	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	RAX1	Q08760	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	AKR2	Q12013	749 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	RUP1	Q12242	671 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	TPO4	Q12256	659 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	STE7	P06784	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	COS2	P0CX12	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	COS3	P0CX13	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	PMT2	P31382	759 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	NDC1	P32500	655 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	CIN4	P39110	191 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	MET18	P40469	1032 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	CUP9	P41817	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	PRM10	P42946	383 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	COS4	P43542	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	YDL186W	P48568	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	IRC15	Q02733	499 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	GAS3	Q03655	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	APC4	Q04601	652 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	HUA2	Q12134	243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
PEX22	YAL055W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	YCR102C	P25608	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	NAM9	P27929	486 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	PTR2	P32901	601 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	YIL001W	P40560	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX22	YAL055W	DST1	P07273	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	OCA4	P25366	362 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	ATS1	P31386	333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	YBR139W	P38109	508 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	YDR089W	P38966	869 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	ICE2	P40499	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	PHB1	P40961	287 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	AIM22	P47051	409 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	YJR154W	P47181	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	RAD17	P48581	401 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	TVP15	Q03860	143 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	FAR8	Q05040	523 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	YEH1	Q07804	573 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	REX3	Q12090	404 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	GET4	Q12125	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	SET6	Q12529	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	MRP13	P12686	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PEX22	YAL055W	DOA1	P36037	715 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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