RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	TIM9	O74700	87 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	GAL1	P04385	528 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	STE7	P06784	515 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	COR1	P07256	457 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	HYM1	P32464	399 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	LDB7	P38210	180 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RKM3	P38222	552 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SWC5	P38326	303 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PIH1	P38768	344 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	AIM18	P38884	321 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MET18	P40469	1032 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	AXL1	P40851	1208 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SMK1	P41808	388 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	QRI7	P43122	407 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SNX4	P47057	423 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CPR7	P47103	393 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YJR149W	P47177	404 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ERG25	P53045	309 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MAL13	P53338	473 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YNR064C	P53750	290 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ESBP6	P53918	673 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RCE1	Q03530	315 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YDR391C	Q04170	232 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PEX10	Q05568	337 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RIF2	Q06208	395 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SWC7	Q06707	132 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YLL007C	Q07799	665 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PSK2	Q08217	1101 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	GSH2	Q08220	491 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YPL199C	Q08954	240 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	HOS1	Q12214	470 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YPR064W	Q12492	139 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	AFI1	Q99222	893 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	DCC1	P25559	380 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	INO2	P26798	304 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MSN2	P33748	704 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	NIC96	P34077	839 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YOR062C	P36025	268 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	VPS51	P36116	164 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RIB1	P38066	345 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RRN10	P38204	145 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TRR2	P38816	342 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YHR177W	P38867	453 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YER010C	P40011	234 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	COG3	P40094	801 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CIR1	P42940	261 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YPI1	P43587	155 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PHO86	P46956	311 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TAF6	P53040	516 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YIP5	P53108	310 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ARP5	P53946	755 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	COG6	P53959	839 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MIX14	Q04341	121 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ECM18	Q04623	453 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	BOP2	Q06150	570 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ATG26	Q06321	1198 aa		0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	BI2	P03873	423 aa		0.34	□□□□□ -2.36
AI1	Q0050	YAR066W	P0CX18	203 aa		0.34	□□□□□ -2.36
AI1	Q0050	YHR214W	P0CX19	203 aa		0.34	□□□□□ -2.36
AI1	Q0050	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		0.34	□□□□□ -2.36
AI1	Q0050	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		0.34	□□□□□ -2.36
AI1	Q0050	TFS1	P14306	219 aa		0.34	□□□□□ -2.36
AI1	Q0050	SPO16	P17122	198 aa		0.34	□□□□□ -2.36
AI1	Q0050	VPS33	P20795	691 aa		0.34	□□□□□ -2.36
AI1	Q0050	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
AI1	Q0050	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36

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