RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TDA6Q06466 467 aa3.38□□□□□ -1.87
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 COX6P00427 148 aa3.36□□□□□ -1.87
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ADE12P80210 433 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPL034WQ03083 165 aa3.35□□□□□ -1.87
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SBE2P42223 864 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NAM8Q00539 523 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ALR1Q08269 859 aa3.34□□□□□ -1.87
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CEM1P39525 442 aa3.33□□□□□ -1.88
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CLB5P30283 435 aa3.32□□□□□ -1.88
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBL086CP38177 466 aa3.32□□□□□ -1.88
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CUZ1P53899 274 aa3.32□□□□□ -1.88
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AMN1P38285 549 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MCX1P38323 520 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CDC19P00549 500 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LSB6P42951 607 aa3.29□□□□□ -1.88
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPA14P50106 137 aa3.29□□□□□ -1.88
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNR014WP53719 212 aa3.29□□□□□ -1.88
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPR097WQ06839 1073 aa3.29□□□□□ -1.88
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YCK2P23292 546 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SIT4P20604 311 aa3.27□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PSE1P32337 1089 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TBF1Q02457 562 aa3.25□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ALO1P54783 526 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SYT1Q06836 1226 aa3.24□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MCA1Q08601 432 aa3.24□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDL206WQ12424 762 aa3.24□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SLY41P22215 453 aa3.23□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 OMA1P36163 345 aa3.23□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TAT1P38085 619 aa3.23□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDR215CQ12240 137 aa3.23□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BOI2P39969 1040 aa3.22□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PUS6P53294 404 aa3.22□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VTC4P47075 721 aa3.21□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AVT1P47082 602 aa3.21□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 APP1P53933 587 aa3.21□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DIT1P21623 536 aa3.2□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VAC17P25591 423 aa3.2□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EMW1P42842 904 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 INP52P50942 1183 aa3.19□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KRE33P53914 1056 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDR461C-AQ2V2P7 80 aa3.18□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MET1P36150 593 aa3.17□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DFG5Q05031 458 aa3.17□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPR148CQ06523 435 aa3.17□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DAL1P32375 460 aa3.16□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NIS1P53939 407 aa3.16□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BDS1Q08347 646 aa3.16□□□□□ -1.9
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MKS1P34072 584 aa3.15□□□□□ -1.91
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TEA1P47988 759 aa3.15□□□□□ -1.91
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GPM1P00950 247 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data3.13□□□□□ -1.91not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GIS1Q03833 894 aa3.13□□□□□ -1.91
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ITT1Q04638 464 aa3.13□□□□□ -1.91
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UBP15P50101 1230 aa3.12□□□□□ -1.91
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TRM1P15565 570 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRY1P47032 299 aa3.11□□□□□ -1.91
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VPS70P47161 811 aa3.11□□□□□ -1.91
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMR196WQ04336 1088 aa3.11□□□□□ -1.91
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FPK1P53739 893 aa3.09□□□□□ -1.91
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AOS1Q06624 347 aa3.09□□□□□ -1.91
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 STE6P12866 1290 aa3.07□□□□□ -1.92
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FBP26P32604 452 aa3.07□□□□□ -1.92
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NAF1P53919 492 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FPS1P23900 669 aa3.06□□□□□ -1.92
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KNS1P32350 737 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ELM1P32801 640 aa3.03□□□□□ -1.92
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DLD3P39976 496 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UBP5P39944 805 aa3.02□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PDC5P16467 563 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SCJ1P25303 377 aa3.01□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPP2BP02400 110 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SLA1P32790 1244 aa3□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSN5P52918 1224 aa3□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PBS2P08018 668 aa2.99□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TPS3P38426 1054 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LIP5P32875 414 aa2.98□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HST2P53686 357 aa2.98□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MED7Q08278 222 aa2.98□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MMP1Q12372 583 aa2.98□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AHP1P38013 176 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SSN3P39073 555 aa2.97□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ISU1Q03020 165 aa2.97□□□□□ -1.93
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FIG4P42837 879 aa2.96□□□□□ -1.94
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MAM3Q12296 706 aa2.96□□□□□ -1.94
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-DR3Q12441 440 aa2.96□□□□□ -1.94
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BUD9P53226 547 aa2.95□□□□□ -1.94
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YKL222CP35995 705 aa2.94□□□□□ -1.94
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PGM1P33401 570 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRPL16P38064 232 aa2.93□□□□□ -1.94
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TRP3P00937 484 aa2.92□□□□□ -1.94
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YCR015CP25616 317 aa2.92□□□□□ -1.94
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GLN1P32288 370 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data2.92□□□□□ -1.94not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KAE1P36132 386 aa2.92□□□□□ -1.94
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YKR073CP36153 106 aa2.92□□□□□ -1.94
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NHA1Q99271 985 aa2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.4 ms